随笔分类 -  R

12.RcolorBrewer包
摘要：##转载：https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1580734081&ver=2136&signature=E8KwbW4f33UyMcGvhUamQcgQtgJWLZUaInAyDtbpLK6brLi1-VD6lgZFIwjqS*4EzQ9SqcC 阅读全文
posted @ 2020-02-04 12:09 风中之铃 阅读(1547) 评论(0) 推荐(0)
11.R语言流程
摘要：1、安装软件包 常见软件仓库3个： 1.1 CRAN : install.packages('package') 1.2 Bioconductor: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE)) install.packages("BiocM 阅读全文
posted @ 2020-01-29 15:30 风中之铃 阅读(500) 评论(0) 推荐(0)
10、差异基因topGO富集
摘要：参考：http://www.biotrainee.com/thread-558-1-1.html http://bioconductor.org/packages/3.7/bioc/ http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/top 阅读全文
posted @ 2018-08-19 20:38 风中之铃 阅读(2586) 评论(0) 推荐(0)
10、R常用命令
摘要：转载：http://www.bio-info-trainee.com/579.html 关于R语言包的一些操作，挺重要的！！！ R的包（package）通常有两种：1 binary package：这种包属于即得即用型（ready-to-use），但是依赖与平台，即Win和Linux平台下不同。2  阅读全文
posted @ 2018-05-12 15:31 风中之铃 阅读(272) 评论(0) 推荐(0)
9、par画图参数
摘要：转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_8f5b2a2e0102v0tf.html 1、 函数par()的使用格式如下： par(..., no.readonly = FALSE) 其中...表示所有类似于tag=value形式的参数。下面会具体的对这些参数进行描述。当参 阅读全文
posted @ 2018-04-30 14:07 风中之铃 阅读(374) 评论(0) 推荐(0)
6、R语言绘制带errorbar 的柱状图
摘要：转载：http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/7283733.html data <- data.frame(mean = c(10, 15), sd = c(12, 17))rownames(data) <- c("case", "control") par(lw 阅读全文
posted @ 2017-08-20 14:08 风中之铃 阅读(1924) 评论(0) 推荐(0)
1、R-reshape2-cast
摘要：1、cast: 长型数据转宽型数据 （1）、acast,dcast的区别在于输出结果。acast 输出结果为vector/matrix/array，dcast 输出结果为data.frame。 dcast(data, formula, fun.aggregate = NULL, ..., margi 阅读全文
posted @ 2017-05-21 20:39 风中之铃 阅读(1094) 评论(0) 推荐(0)
2、R-reshape2-melt
摘要：1、melt: 短数据转长数据 （1）、融合的数据为数组、表以及矩阵，melt的表达式为： melt(data, varnames = names(dimnames(data)), ..., na.rm = FALSE, as.is = FALSE, value.name = "value")长 n 阅读全文
posted @ 2017-05-21 20:01 风中之铃 阅读(534) 评论(0) 推荐(0)