摘要:##转载:https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1580734081&ver=2136&signature=E8KwbW4f33UyMcGvhUamQcgQtgJWLZUaInAyDtbpLK6brLi1-VD6lgZFIwjqS*4EzQ9SqcC 阅读全文
posted @ 2020-02-04 12:09 风中之铃 阅读(765) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1、安装软件包 常见软件仓库3个: 1.1 CRAN : install.packages('package') 1.2 Bioconductor: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE)) install.packages("BiocM 阅读全文
posted @ 2020-01-29 15:30 风中之铃 阅读(183) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:转载:https://www.cnblogs.com/gandoufu/p/9748841.html https://blog.csdn.net/tuzixini/article/details/81560980 1、查看 conda 版本号 conda -V conda --version 2、c 阅读全文
posted @ 2019-08-20 15:50 风中之铃 阅读(424) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1、下载安装 https://bitbucket.org/mroachawri/purge_haplotigs/wiki/Install 1、Dependencies (in no particular order) bedtools $ sudo apt install bedtools $ be 阅读全文
posted @ 2019-08-06 17:52 风中之铃 阅读(895) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:一、MCSCAN 参考 :http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/MCScanX.zip http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm 安装 :unzip MCscanX.zip && cd MCScanX && make 安装报错: 报 阅读全文
posted @ 2019-07-25 20:02 风中之铃 阅读(1642) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1、基因树(Gene tree): 当一个分子系统树是根据某一个基因数据构建而来的,称为基因树. 2、物种树(Species tree): 是指代表一组物种进化过程的系统树. 3、基因树与物种树的关系 分子系统学的目的,就是通过分子树来推测物种树.在许多情况下这两者是一致的。 基因树与物种数的冲突原 阅读全文
posted @ 2019-07-02 14:32 风中之铃 阅读(1086) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:参考: https://www.sogou.com/link?url=hedJjaC291NYNxVe4xgB4c3bUxXRMqZrT93cntTAgYfyBbRAdP9kIA.. https://liucheng.name/457/ 官网下载: https://webblast.ipk-gate 阅读全文
posted @ 2019-05-28 16:13 风中之铃 阅读(862) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:参考:https://www.jianshu.com/p/8ffd53b1bd41 perl自带的perldoc文档.perldoc -v '$/' ;perldoc -f join $/ #输入记录分隔符,默认为换行符 "\n" , 设置这个操作符会影响chomp操作,chomp默认是去掉行尾的" 阅读全文
posted @ 2019-05-27 10:29 风中之铃 阅读(587) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:转载:http://www.realbio.cn/news/124.html https://blog.csdn.net/seallama/article/details/43820763 http://www.cnblogs.com/huangying78/p/8638506.html 1. 数据 阅读全文
posted @ 2018-12-16 12:51 风中之铃 阅读(3308) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1、常见的输出格式整理 awk '{print "this is " $1, $2, $1*$2, NR, NF, $NF}' file1 ###字符输出,字段输出,运算输出,内置变量输出等,默认空格分开;$1 ,$2调换顺序打印随之变化 awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {print 阅读全文
posted @ 2018-12-09 17:20 风中之铃 阅读(2950) 评论(0) 推荐(0) 编辑