摘要: 最近在做分析的时候,遇到了T检验,然而对于没有统计学背景的人来说完全不知如何下手 当然了,遇到问题第一反应就是百度。 果然百度出来了很多链接,当时第一次直接选择了用Excel去做T检验。下面是源数据 下面是Excel的结果, 结果竟然是不显著的!!! 后来又专门请教了师兄,用SPASS重新做了一遍, 阅读全文
posted @ 2018-08-31 20:03 忆昔烟雨情 阅读(22313) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 1 在利用branch-site检测趋同进化的时候 2 3 1.可以将各个趋同进化枝分别进行检测,分析的时候不去除某一趋同枝系 4 2.在分析的时候,需要去除其他趋同枝系的影响 1 I have 25 sequences of a bacteria gene each from one strain. Among them, there are five strains belo... 阅读全文
posted @ 2018-08-30 01:06 忆昔烟雨情 阅读(238) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1 使用默认的设置: 2 3 $ Gblocks proteins.fasta -t=p 4 5 必须是 fasta 文件在前,参数在后。若没有参数,则进入交互式界面。 6 7 8 Gblocks cds.fasta −t=c −b1=“$b1” −b2=“$b1” −b3=1 −b4=6 −b5=h 9 10 11 ########################... 阅读全文
posted @ 2018-08-26 20:27 忆昔烟雨情 阅读(1247) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 第一步,打开文件夹 第二步,在该文件夹下新建一个txt文件,然后将“.txt”后缀名修改为“.bat” txt文件内容“DIR *.* /B >LIST.TXT” 第三步,双击“.bat”,直接生成文件名list 阅读全文
posted @ 2018-08-26 12:03 忆昔烟雨情 阅读(7853) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: Apoptosis Panel for Monitoring Cell Programmed Death and Survival: TNF Ligand Family: LTA, LTB, TNF, TNFSF4, TNFSF5, TNFSF6, TNFSF7, TNFSF8, TNFSF9, TNFSF10, TNFSF11, TNFSF12, TNFSF13, TNFSF13B, TNFS... 阅读全文
posted @ 2018-08-23 22:04 忆昔烟雨情 阅读(2158) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1 target_gene_id n_word || (nchar(x) > 40)) 43 { 44 if (nchar(x) > 40) x <- substr(x, 1, 40) 45 x <- paste(paste(strsplit(x, " ")[[1]][1:min(length(strsplit(x," ")[[1]]), n_word)], 46 ... 阅读全文
posted @ 2018-08-23 08:58 忆昔烟雨情 阅读(10180) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Anaconda作为一个工具包集成管理工具,下载python工具包是很方便的,直接敲: 1 但是有时候安装一个工具包(如skimage)的时候,在当前的channels中找不到这个包,会提示: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 这个时候,我们可以使用下面的指令来查找我 阅读全文
posted @ 2018-08-22 18:25 忆昔烟雨情 阅读(5595) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 注:还可以参照下面的代码 阅读全文
posted @ 2018-08-14 17:49 忆昔烟雨情 阅读(1458) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1 Trying this option worked for me. 2 3 library(httr) 4 with_config(use_proxy(...), install_github(...)) 5 6 OR 7 8 library(httr) 9 set_config(use_proxy(url = "******_", port = "_*")) 10 ... 阅读全文
posted @ 2018-08-11 21:56 忆昔烟雨情 阅读(14857) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: 前段时间遇到开发人员更新glibc版本,把/usr/lib64/libc-2.12.so & libc.so.6 -> libc-2.12.so 这个软连接更改之后导致报错: ls: error while loading shared libraries: libc.so.6: cannot op 阅读全文
posted @ 2018-08-09 13:15 忆昔烟雨情 阅读(1485) 评论(0) 推荐(0) 编辑