摘要:
作物模型提出很早,但应用有限。看起来复杂,其实解决的是环境与表型间的关联,可参考前期推文:作物生长模型CropGrow。环境组的复杂,关键在于数据的准确性获取。对于数据分析人员来说,如果不care数据准确性,分析其实很简单的,就是经典的机器学习流程。 这里提供一段伪代码仅供参考。 1. 导库 imp 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:24
生物信息与育种
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摘要:
近日,中国农科院植保所联合扬州大学、湖南农大等在中国工程院主刊 Engineering (一区top, IF=12.8)上发表了题为《Development of Machine Learning Methods for Accurate Prediction of Plant Disease Re 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:22
生物信息与育种
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摘要:
本文来自CABI的一篇综述要点。文章探讨了通过选择、杂交、诱变和重组实现的新的遗传变异性,以及植物育种技术创新如何为作物改良提供更精准和更高分辨率的方法。 引言 随着全球人口的增长和气候变化带来的挑战,粮食安全成为全球关注的重点。预计到 2050 年,世界人口将达到 100 亿,这要求我们不仅要养活 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:21
生物信息与育种
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分享来自张学勇老师的一篇综述。 遗传多样性是一个物种在自然界生存的基础,也是作物遗传改良的基石。经过近100年的考察、收集、评价、编目、入库,全球收集种质资源约740万份,存放在1750个种质库中;我国收集各类作物种质资源总量达50万份。丰富的资源一方面为作物改良奠定了基础,另一方面也带来了困扰,即 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:20
生物信息与育种
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北京市农林科学院信息技术研究中心赵春江院士团队联合华中农业大学杨万能教授团队发布在PBJ上的综述文章:Plant microphenotype: from innovative imaging to computational analysis,深入探讨了植物微观表型(microphenotype) 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:18
生物信息与育种
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摘要:
分享一篇水稻种质资源创新研究与利用的相关综述,内容比较全面,包括了我国水稻种质资源收集、评价与精确鉴定、水稻新品系创制、水稻杂种优势利用、水稻种质创制新技术、新方法以及水稻优异基因资源的挖掘与利用等方面。 截止到2023 年,我国保存的作物种质资源有超过54 万份,其中有8 万多份是水稻种质资源,数 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:09
生物信息与育种
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本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具,并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。 水稻基因组数据库 水稻转录和转录后调控数据库 水稻基因网络数据库 水稻种质资源信息数据库 水稻常用的基因编辑系统 水稻基因编辑生物信息工具与数据库 水稻智能育种生物信息工具 专家简介: 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:07
生物信息与育种
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全球主要可用的高通量表型分析设施列表 参考1 参考2 来源:赵春江,植物表型组学大数据及其研究进展 参考3 来源:High-Throughput Phenotyping: A Platform to Accelerate Crop Improvement 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:06
生物信息与育种
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4 月在南京参加了第七届全国玉米生物学学术研讨会,诚如大会名字所言的“学术研讨”,邀请了国内外相关领域具有重要学术影响力的专家学者和优秀青年科学家进行学术报告及成果展示,与育种产业相关的内容很少。但能够看到的是,接地气的研究越来越多(最多的还是功能基因组学研究),学术与产业融合得越来越紧密。 今年( 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:05
生物信息与育种
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品种是玉米高产的基础,进一步提高品种耐密性和种植密度是提高玉米单产的关键。 在近80 年中,美国玉米单产提升了近8 倍,这个过程中种植密度从平均每亩2000 多株增加到近6000 株,种植密度贡献显著。 我国高产玉米新品种更新迭代过程中,玉米株型也逐渐从平展型演变成紧凑型,品种的耐密性明显提高,但和 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:04
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