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摘要: ❝ 我们能教会计算机理解人类语言,同样也能让它们读懂DNA。 2023年10月31日,加利福尼亚大学伯克利分校的科学家们在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了一篇突破性研究,提出了一种基于无监督DNA语言模型的新方法,该方法在全基因组范围内预测基因变异效果上,超越了现有的保守性评分模型。 研究团队 阅读全文
posted @ 2024-09-08 15:35 生物信息与育种 阅读(110) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Resistify是一个用于快速且准确地注释植物中的NLRs(Nucleotide-binding domain Leucine-rich Repeat,核苷酸结合域富含亮氨酸重复序列)并提供准确结构分类的工具。NLRs是植物先天免疫系统的关键组成部分,具有显著的存在/缺失变异和序列多样性。Resi 阅读全文
posted @ 2024-09-08 15:28 生物信息与育种 阅读(67) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 植物细胞具有异质性,同一基因的表达量在同一组织的不同细胞类型中可能不同,当我们挖掘胁迫响应基因或发育相关基因时,如果利用传统的转录组测序(Bulk RNA-seq)策略去检测基因的表达模式,一些细胞类型特异性基因的表达信号将会被掩盖,也使我们很难从细胞水平检测出最先响应的因子,以及探究逆境或发育信号 阅读全文
posted @ 2024-09-08 15:27 生物信息与育种 阅读(78) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 果树基因组与遗传改良 2023年,南京农业大学吴俊教授团队发表在Plant Physiology的题为 “Genomic insights into domestication and genetic improvement of fruit crops”的长篇综述,系统总结了果树基因组学与遗传改良 阅读全文
posted @ 2024-09-08 15:25 生物信息与育种 阅读(133) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 来源:第一届全国作物杂种优势与生物育种学术大会,严建兵老师报告《玉米基因组育种的理论与实践》。 声明:本文仅用于学习交流,不用于任何商业用途。文中所有转载的图片、音频、视频文件等知识归该权利人所有。如不慎侵犯权益,请后台联络,我们将第一时间删除。 阅读全文
posted @ 2024-09-08 15:25 生物信息与育种 阅读(29) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 分享一篇来自南洋理工大学Marek Mutwil团队发表在《Trends in Plant Science》上有关植物生物学方向的大语言模型综述:Large language models in plant biology。生物序列本身就是一种自然语言,与LLM是天作之合,实际上生物大模型已有很多开 阅读全文
posted @ 2024-09-08 15:23 生物信息与育种 阅读(398) 评论(0) 推荐(0)
摘要: RNAseqQC通过一个提供一系列数据可视化功能来帮助RNAseq数据质量控制的R包,它允许识别具有不需要的生物或技术影响的样品,并探索差异测试结果。 源码:https://github.com/frederikziebell/RNAseqQC 安装指南 安装过程简单明了,只需在R环境中执行以下命令 阅读全文
posted @ 2024-07-28 17:35 生物信息与育种 阅读(130) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 分享中国农业大学数字农业创新团队马韫韬老师报告。 声明:本文仅用于学习交流,不用于任何商业用途。文中所有转载的图片、音频、视频文件等知识归该权利人所有。如不慎侵犯权益,请后台联络,我们将第一时间删除。 视频(阅读原文跳转): https://www.bilibili.com/video/BV1zS4 阅读全文
posted @ 2024-07-28 17:33 生物信息与育种 阅读(51) 评论(0) 推荐(0)
摘要: ❝ 我们能教会计算机理解人类语言,同样也能让它们读懂DNA。 2023年10月31日,加利福尼亚大学伯克利分校的科学家们在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了一篇突破性研究,提出了一种基于无监督DNA语言模型的新方法,该方法在全基因组范围内预测基因变异效果上,超越了现有的保守性评分模型。 研究团队 阅读全文
posted @ 2024-07-28 17:32 生物信息与育种 阅读(179) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Resistify是一个用于快速且准确地注释植物中的NLRs(Nucleotide-binding domain Leucine-rich Repeat,核苷酸结合域富含亮氨酸重复序列)并提供准确结构分类的工具。NLRs是植物先天免疫系统的关键组成部分,具有显著的存在/缺失变异和序列多样性。Resi 阅读全文
posted @ 2024-07-28 17:31 生物信息与育种 阅读(365) 评论(0) 推荐(0)
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