摘要:
MAGIC群体简介 植物遗传研究的重要优势是遗传群体构建的便利。传统上用于遗传作图的主要有基于连锁分析的双亲群体和基于关联分析的自然群体和多亲群体。但由于双亲群体的遗传背景狭窄,可定位的 QTL 有限,自然群体存在群体结构和低频变异等缺陷,多亲群体的关联分析检测功效低等原因,很难在单个群体中定位多个 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:46
生物信息与育种
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尽管相关研究已取得诸多进展,但抗病位点在育种实践中的应用仍面临若干关键挑战。首先,具有重要育种价值的遗传信息分散于大量文献中,这使得获取和解析全面的抗性图谱存在显著障碍。其次,抗病位点间的复杂互作关系及其对不同条锈菌生理小种抗性表现的动态差异尚不明确。再次,QTL区间内候选基因的筛选及其功能解析需要 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:44
生物信息与育种
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摘要:
分享一则 来自Violina Bharali 博士课程报告——《Accelerating crop genetic gains with genomic selection》 。基因组选择通过“全基因组预测 + 快速世代 + 高通量数据”三重加速,让作物育种从“马拉松”变成“接力赛”,为保障粮食安全 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:38
生物信息与育种
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分享一篇来自布宜诺斯艾利斯大学今年发表的综述文章《50 years of breeding to improve yield: how maize stands up to climate change》,该文回顾了过去50年玉米育种在提高产量方面的成就,分析了这些改良如何帮助玉米适应气候变化,并探 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:37
生物信息与育种
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分享一篇最近发表在Nature Methods上的生物智能体: GeneAgent。这是一个基于 LLM 的智能体,用于基因集分析;它通过与生物数据库的自主交互来验证自身输出,从而减少幻觉。在来自不同来源的 1,106 个基因集上的评估表明,GeneAgent 的准确性显著优于 GPT-4。专家评审 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:35
生物信息与育种
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转录因子 (TFs) 是通过结合 DNA 来控制基因表达时空定位的蛋白质。在植物中,数十个 TF 家族与不同的结合位点 (TFBSs) 集合相互作用,这些位点反映了每个 TF 在生物体功能和物种特异性适应中的作用。然而,定义这些作用并理解调控演化的更广泛模式仍然具有挑战性,因为预测的 TFBS 可能 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:34
生物信息与育种
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2025年5月28日,英国洛桑研究所(Rothamsted Research) Christophe Lambing团队于Plant Communications 在线发表了题为Integrating genome editing with omics, artificial intelligenc 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:32
生物信息与育种
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分享一篇报告:分子和数量遗传学为作物改良带来最大遗传增益。主要内容如下: 研究背景与意义 • 遗传增益(Genetic Gain):指通过育种选择,在群体中平均遗传值或表型值的提升。 • 现实需求: • 到2050年粮食产量需翻倍; • 气候变化可能导致产量下降20%; • 当前遗传增益率仅0.8– 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:28
生物信息与育种
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分享一篇来自德国霍恩海姆大学(University of Hohenheim)的Carl Friedrich Horst Longin团队在《Crop Science》杂志发表题为“Insights into a genomics-based pre-breeding program in whea 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:26
生物信息与育种
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摘要:
分享一本2024年由哈尔滨医科大学编写、科学出版社出版的书籍——《基因组遗传大数据分析方法》。 本书围绕基因组遗传大数据分析的基本方法,首先介绍了遗传变异和表观遗传变异的基本概念,接着介绍了相关分析方法及软件,包括全基因组关联分析(GWAS)、全基因组交互作用分析、连锁不平衡分析、全基因组单倍型关联 阅读全文
posted @ 2025-10-25 20:21
生物信息与育种
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