小鲨鱼2018

2021年11月6日

摘要：来源：https://blog.csdn.net/systiger/article/details/107670404 想玩docker的话：以管理员身份运行cmd：bcdedit /set hypervisorlaunchtype auto重启；想玩虚拟机的话：以管理员身份运行cmd：bcdedi 阅读全文

posted @ 2021-11-06 19:21 小鲨鱼2018 阅读(200) 评论(0) 推荐(0)

docker笔记

摘要： 1、三个关键概念镜像（类似操作系统）、容器（独立环境，集装箱）、仓库（储存镜像）。 2、常用命令 a、docker info ## 查看基本信息 C:\Users\75377>docker info Client: Debug Mode: false Plugins: compose: Doc 阅读全文

posted @ 2021-11-06 16:41 小鲨鱼2018 阅读(496) 评论(0) 推荐(0)

2021年11月5日

could not find function "read_excel"

摘要： 1、问题 2、解决方法 install.packages("readxl") library("readxl") test <- read_excel("cor.xlsx", sheet = 1, col_names = T, col_types = NULL) dim(test) 阅读全文

posted @ 2021-11-05 18:46 小鲨鱼2018 阅读(7909) 评论(0) 推荐(0)

R语言中计算几何平均数

摘要：几何平均数：几何平均数是对各变量值的连乘积开项数次方根。求几何平均数的方法叫做几何平均法。如果总水平、总成果等于所有阶段、所有环节水平、成果的连乘积总和时，求各阶段、各环节的一般水平、一般成果，要使用几何平均法计算几何平均数，而不能使用算术平均法计算算术平均数。（百度百科）几何平均数：几何平均数是阅读全文

posted @ 2021-11-05 11:45 小鲨鱼2018 阅读(1151) 评论(0) 推荐(0)

R语言中计算变异系数

摘要：变异系数：变异系数（Coefficient of Variation）：当需要比较两组数据离散程度大小的时候，如果两组数据的测量尺度相差太大（比如cm, km），或者数据量纲(比如重量，长度）的不同，直接使用标准差来进行比较不合适，此时就应当消除测量尺度和量纲的影响，而变异系数可以做到这一点，它是原阅读全文

posted @ 2021-11-05 11:27 小鲨鱼2018 阅读(5546) 评论(0) 推荐(0)

R语言中统计频数分布

摘要： 1、测试数据 test <- c(5.3, 5.6, 0.7, 0.6, 1.3, 2.8, 2.9, 2.1, 2.4, 3.7, 4.2, 4.9, 4.7, 4.8, 4.2) 2、生成统计节点 breaks <- seq(0, 6, length.out = 7) ## 生成统计节点 bre 阅读全文

posted @ 2021-11-05 11:10 小鲨鱼2018 阅读(2788) 评论(0) 推荐(0)

2021年11月3日

R语言中如何将数据从矩阵转换为3列的形式

摘要： 1、方式1 test <- matrix(1:12, byrow = T, nrow = 3, ncol = 4) test c1 <- rep(1:nrow(test), times = ncol(test)) c2 <- rep(1:ncol(test), each = nrow(test)) 阅读全文

posted @ 2021-11-03 18:18 小鲨鱼2018 阅读(1477) 评论(0) 推荐(0)

R语言中如何统计数据框中某一个元素出现的次数

摘要： 1、 a <- c("b", "a", "b") b <- c("c", "b", "a") c <- c("x", "a", "d") d <- data.frame(a, b, c) d e <- unlist(d) e sum(e == "b") ## 统计b出现的次数 sum(e == "d 阅读全文

posted @ 2021-11-03 18:00 小鲨鱼2018 阅读(6419) 评论(0) 推荐(0)

plink + R构建G矩阵

摘要： 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# cat outcome.map 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 snp3 0 122948 1 snp4 0 203 阅读全文

posted @ 2021-11-03 16:45 小鲨鱼2018 阅读(582) 评论(0) 推荐(0)

2021年11月2日

linux shell 实现 plink --recode A 命令

摘要： 1、 cut -d " " -f 7- $1 > nuc.ped awk '{for(i = 1; i <= NF; i = i + 2) {printf("%s ", $i)} {printf("\n")}}' nuc.ped > top.ped awk '{for(i = 2; i <= NF; 阅读全文

posted @ 2021-11-02 23:28 小鲨鱼2018 阅读(456) 评论(0) 推荐(0)

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