linux shell - 随笔分类(第44页) - 小鲨鱼2018

linux系统中如何将每行特定数目字符后的字符替换为指定字符

摘要：001、 root@PC1:/home/test3# ls a.txt root@PC1:/home/test3# cat a.txt e r e y e u e e e g e 3 h r 1 3 e g e y e e s e e e e e root@PC1:/home/test3# cp a 阅读全文

posted @ 2022-07-22 23:24 小鲨鱼2018 阅读(228) 评论(0) 推荐(0)

linux 中如何将多行数据转换为一行数据

摘要：001、paste -s实现 root@PC1:/home/test3# ls a.txt root@PC1:/home/test3# cat a.txt j k u k r k s k j u e a f d e u i w j j k k e f root@PC1:/home/test3# pa 阅读全文

posted @ 2022-07-22 23:13 小鲨鱼2018 阅读(448) 评论(0) 推荐(0)

linux 系统中如何删除行首的空格或者制表符

摘要：001、sed实现 root@PC1:/home/test3# ls a.txt root@PC1:/home/test3# cat a.txt j k u k r k s k j u e a f d e u i w j j k k e f root@PC1:/home/test3# sed 's/ 阅读全文

posted @ 2022-07-22 23:00 小鲨鱼2018 阅读(370) 评论(0) 推荐(0)

linux 中统计每一行特定字符出现的次数

摘要：001、 root@PC1:/home/test3# ls a.txt root@PC1:/home/test3# cat a.txt ## 测试数据，统计每一行出现的k的次数 j k u k r k s k j u e a f d e u i w j j k k e f root@PC1:/ho 阅读全文

posted @ 2022-07-22 22:53 小鲨鱼2018 阅读(779) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 tgz压缩文件的生成及解压

摘要：001、tgz文件的生成 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# ls outcome.map outcome.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# md5sum outcome.* 3512684a76436a00efbeda68c 阅读全文

posted @ 2022-07-21 22:04 小鲨鱼2018 阅读(2068) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 awk命令输出一列数据中的最小值、最大值

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat a.txt 5 8 2 7 9 30 1 10 3 6 7 5 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# awk '{if(NR == 1) {mi 阅读全文

posted @ 2022-07-19 09:56 小鲨鱼2018 阅读(775) 评论(0) 推荐(0)

linux 中awk命令计算同一列相邻上数值的差

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat a.txt 1570051 1570053 5188621 5178672 518870 阅读全文

posted @ 2022-07-18 23:47 小鲨鱼2018 阅读(385) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 sort -V 选项

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat a.txt Chr8 Chr4 Chr1 Chr3 Chr7 Chr10 Chr11 Chr12 Chr2 阅读全文

posted @ 2022-07-18 17:15 小鲨鱼2018 阅读(113) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 sort命令 -k选项

摘要：sort -k选项用于指定按照哪一列进行排序。 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls facebook.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat facebook.txt google 110 阅读全文

posted @ 2022-07-18 12:43 小鲨鱼2018 阅读(1706) 评论(0) 推荐(0)

linux 中shell统计fasta文件中每条染色体上的碱基数目

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# ls test.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat test.fa >Chr1 ACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAA 阅读全文

posted @ 2022-07-17 23:21 小鲨鱼2018 阅读(109) 评论(0) 推荐(0)

linux shell统计 fasta文件中每条染色体上的碱基数

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# ls test.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat test.fa ## 测试fasta文件 >Chr1 ACCCTAAACCCTAAA 阅读全文

posted @ 2022-07-17 22:35 小鲨鱼2018 阅读(114) 评论(0) 推荐(0)

linux 中删除匹配特定字符的行及其后的若干行

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 1 01 2 02 3 AAA 4 03 5 04 6 03 7 BBB 8 06 9 07 10 BBB 11 0 阅读全文

posted @ 2022-07-17 21:50 小鲨鱼2018 阅读(724) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 sed命令匹配特定字符之间的数据

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 01 02 AAA 03 04 05 BBB 06 07 08 CCC 09 10 root@DESKTOP-1N4 阅读全文

posted @ 2022-07-17 21:26 小鲨鱼2018 阅读(1066) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 sed匹配特定字符并输出其后的若干行

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt ## 测试数据 01 1 02 2 AA 3 03 4 04 5 05 6 BB 7 06 8 07 9 AA 10 阅读全文

posted @ 2022-07-17 21:00 小鲨鱼2018 阅读(2242) 评论(0) 推荐(0)

linux 系统中在不解压情况下查看大型压缩文件

摘要：001、zmore root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls outcome.ped.gz root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# zmore outcome.ped.gz 002、zless root@DESKTOP-1N42TVH:/h 阅读全文

posted @ 2022-07-14 12:15 小鲨鱼2018 阅读(151) 评论(0) 推荐(0)

linux 中实现数据的每一列都对齐

摘要：001、column -t实现 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# ls xxx.genome root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# cat xxx.genome ## 测试数据 FID1 IID1 FID2 IID2 RT EZ Z0 阅读全文

posted @ 2022-07-13 22:18 小鲨鱼2018 阅读(963) 评论(0) 推荐(1)

plink 软件中 Total genotyping rate 指的是什么？

摘要：1、Total genotyping rate：所有位点的基因分型率。 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls outcome.map outcome.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# cat outcome.ma 阅读全文

posted @ 2022-07-12 16:04 小鲨鱼2018 阅读(474) 评论(0) 推荐(0)

linux 中如何在文件指定的位置插入特定的行

摘要：001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt b.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt e r s s f w z x v z v e root@DESKTOP-1N42TVH:/home/t 阅读全文

posted @ 2022-07-11 10:45 小鲨鱼2018 阅读(1127) 评论(0) 推荐(0)

linux 中如何在文件指定位置插入特定的列

摘要：001、插入列 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt b.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt e r s s f w z x v z v e root@DESKTOP-1N42TVH:/hom 阅读全文

posted @ 2022-07-11 10:36 小鲨鱼2018 阅读(1642) 评论(0) 推荐(0)

linux 中将科学计数法转换为数值表示（或将数值转换为科学技术法）

摘要：001、科学计数法转换为普通数值表示 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt b.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 4.530733e-01 4.530733e-01 2.264793e-01 阅读全文

posted @ 2022-07-09 09:37 小鲨鱼2018 阅读(436) 评论(0) 推荐(0)

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