linux shell - 随笔分类(第43页) - 小鲨鱼2018

linux 中 if条件判断符 [ -s file ]选项

摘要：-s选项； 01、文件不存在；为假 02、文件存在，但是大小为空；为假 03、文件存在，且大小不为空；为真 001、 [ -s file ]：文件存在且不为0是为真。 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.txt b.txt (base) root@PC1:/ho 阅读全文

posted @ 2022-08-11 13:46 小鲨鱼2018 阅读(1056) 评论(0) 推荐(0)

linux 中将多个连续的空行压缩为一个空行

摘要：001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.txt (base) root@PC1:/home/test2# cat a.txt 1 2 8 10 (base) root@PC1:/home/test2# cat -s a.txt ## 将多个连续的空行压缩为一个空阅读全文

posted @ 2022-08-11 13:35 小鲨鱼2018 阅读(65) 评论(0) 推荐(0)

linux 中常见的字符串比较运算符

摘要：001、 = 判断字符串是否相同 (base) root@PC1:/home/test2# a=abcd (base) root@PC1:/home/test2# b=opqr (base) root@PC1:/home/test2# c=abcd ## 测试字符串 (base) root@PC1: 阅读全文

posted @ 2022-08-11 13:25 小鲨鱼2018 阅读(603) 评论(0) 推荐(0)

linux 中shell脚本统计fasta文件每一个scafflod的碱基总数目

摘要：001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.fasta (base) root@PC1:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >scaffold_1 CCCGGGTAAAACGGGTCTTCAAGAAAACGCTCCTCCGTT 阅读全文

posted @ 2022-08-10 01:24 小鲨鱼2018 阅读(201) 评论(0) 推荐(0)

linux 中shell将fasta文件的每一个scafflod的所有碱基整合为一行

摘要：001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.fasta (base) root@PC1:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >scaffold_1 CCCGGGTAAAACGGGTCTTCAAGAAAACGCTCCTCCGTT 阅读全文

posted @ 2022-08-10 01:21 小鲨鱼2018 阅读(267) 评论(0) 推荐(0)

linux 中conda 更换国内源

摘要：001、 (base) root@ubuntu01pc1:~# conda --version ## conda版本 conda 4.12.0 002、在终端执行如何命令 conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn 阅读全文

posted @ 2022-08-08 21:03 小鲨鱼2018 阅读(1398) 评论(0) 推荐(0)

linux 中vim 中的回退、前进

摘要：001、回退：u 前进：ctrl + r 阅读全文

posted @ 2022-08-08 19:18 小鲨鱼2018 阅读(478) 评论(0) 推荐(0)

ubuntu 中如何创建root用户

摘要：001、 liujiaxin01@ubuntu01pc1:~/Desktop$ whoami liujiaxin01 liujiaxin01@ubuntu01pc1:~/Desktop$ sudo passwd root ## 创建root账户 [sudo] password for liujiax 阅读全文

posted @ 2022-08-08 01:07 小鲨鱼2018 阅读(1800) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 shasum命令

摘要：001、 [root@PC1 test4]# ls a.txt [root@PC1 test4]# shasum a.txt 8b945928bcfa1a6018f3e65d83ad27c6879bd6c8 a.txt [root@PC1 test4]# shasum --algorithm 256 阅读全文

posted @ 2022-08-07 23:50 小鲨鱼2018 阅读(810) 评论(0) 推荐(0)

linux 命令行中常用的快捷键

摘要：001、 ctrl + a：回到行首 ctrl + e：回到行末 ctrl + u：剪切行首到光标处的位置 ctrl + k：剪切光标所在位置到末尾的内容 ctrl + y：粘贴最近剪切的内容阅读全文

posted @ 2022-08-05 00:33 小鲨鱼2018 阅读(205) 评论(0) 推荐(0)

linux 中统计指定列特定字符连续出现的最多次数

摘要：001、shell实现 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC1:/home/test2# cat test.txt 3 a 8 a y a a a f y a a a a a e a a a r k root@PC1:/home/test2# awk ' 阅读全文

posted @ 2022-08-03 15:33 小鲨鱼2018 阅读(207) 评论(0) 推荐(0)

linux 中删除除第一次匹配特定字符串所在行之外的所有行

摘要：001、shell实现 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC1:/home/test2# cat test.txt ## 测试数据，删除第一次匹配xpehh以外的所有匹配xpehh的行 01 ee ff 02 ee de 03 dd ee 04 jj 阅读全文

posted @ 2022-08-03 05:56 小鲨鱼2018 阅读(192) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 awk print > 选项实现按照特定列拆分数据

摘要：001、 root@PC1:/home/test2# ls test.map root@PC1:/home/test2# cat test.map ## 用一个map文件进行测试，按照染色体打乱顺序 6 snp16 0 312984 1 snp2 0 85204 5 snp15 0 204629 6 阅读全文

posted @ 2022-08-03 00:45 小鲨鱼2018 阅读(412) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 gz文件压缩保留源文件、解压缩保留源文件

摘要：001、压缩保留源文件 root@PC1:/home/test2# ls outcome.map root@PC1:/home/test2# gzip -c outcome.map > new.map.gz ## 压缩为gz文件，并保留源文件 root@PC1:/home/test2# ls new 阅读全文

posted @ 2022-08-03 00:20 小鲨鱼2018 阅读(741) 评论(0) 推荐(0)

linux 系统中输出匹配特定字符至末尾的行

摘要：001、 root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt aa dd ss dd ff xv ef 33 cc xx ee ww df ff zc xx xx ff er ed ww xx xx ee er uy vv r 阅读全文

posted @ 2022-08-02 23:21 小鲨鱼2018 阅读(695) 评论(0) 推荐(0)

linux 系统中输出文本开头至匹配特定字符的行

摘要：001、 root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt aa dd ss dd ff xv ef 33 cc xx ee ww df ff zc xx xx ff er ed ww xx xx ee er uy vv r 阅读全文

posted @ 2022-08-02 23:12 小鲨鱼2018 阅读(657) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 tar.lzma 文件的解压、压缩

摘要：001、解压 .tar.lzma文件 root@PC1:/home/test2/test# ls test_chr22.tar.lzma ## 增加 -k 参数保留源文件 unlzma -k test_chr22.tar.lzma root@PC1:/home/test2/test# unlzma 阅读全文

posted @ 2022-08-01 12:06 小鲨鱼2018 阅读(949) 评论(0) 推荐(0)

linux 中如何匹配非空字符

摘要：001、\S：大写S root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt 33-16 CC CC GG TT GG TT GG TT CC 38-11 CC GG GG TT GG TT CC TT CC 4226 CC CC 阅读全文

posted @ 2022-07-29 00:09 小鲨鱼2018 阅读(210) 评论(0) 推荐(0)

Gtk-Message: 14:04:38.467: Failed to load module "canberra-gtk-module"

摘要：001、问题 root@PC1:/home/software# bash TASSEL_5_unix.sh Starting Installer ... Gtk-Message: 14:04:38.467: Failed to load module "canberra-gtk-module" 00 阅读全文

posted @ 2022-07-26 14:08 小鲨鱼2018 阅读(144) 评论(0) 推荐(0)

linux 中awk命令同时指定多个分割符

摘要：001、 root@PC1:/home/test3# ls a.txt root@PC1:/home/test3# cat a.txt e_r:e_y k:e_g_x_3 1_3:e:g:e root@PC1:/home/test3# awk -F "[_:]" '{print $2}' a.txt 阅读全文

posted @ 2022-07-22 23:33 小鲨鱼2018 阅读(450) 评论(0) 推荐(0)

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