计算之道

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2025年8月11日

摘要: 在安装了PRODIGY: 蛋白-蛋白/蛋白-小分子结合能预测工具 后,发现电脑上的colabfold无法使用,报错如下: mrc3@wanglab-node3:test$ bash Run_colabfold.sh Traceback (most recent call last): File "/ 阅读全文
posted @ 2025-08-11 15:59 计算之道 阅读(7) 评论(0) 推荐(0)

摘要: 在线使用 网址: https://rascar.science.uu.nl/prodigy/ 本地使用 1. 一步安装 pip install prodigy-prot 2. 运行 (1)以AF2预测的复合物结构为例,PDB文件中包含AB两条链。 prodigy 000.pdb --selectio 阅读全文
posted @ 2025-08-11 10:14 计算之道 阅读(31) 评论(0) 推荐(0)