摘要：
1. "动物基因组大小" （需FQ) 2. "植物已测序的基因组大小" 3. "真菌基因组大小" 4. "原核生物基因组大小" 5. "NCBI怎么缺呢" 注：若如，可要查近源种 阅读全文
posted @ 2019-06-11 17:00
记号晴
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摘要：
先用conda安装 很顺利 输入 结果 可是输入 这个网上说没有图形界面 可以这样 或者 都可以 阅读全文
posted @ 2019-02-25 11:17
记号晴
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摘要：
一、环境描述 1、系统：CentOS 6.4 i386 (min) 2、登录用户：root 3、版本：CMake 3.14 二、安装步骤 步骤一、安装gcc等必备程序包（已安装则略过此步） 步骤二、安装wget （已安装则略过此步） 步骤三、获取CMake源码包 步骤四、解压CMake源码包 步骤五 阅读全文
posted @ 2019-02-24 16:12
记号晴
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摘要：
一、序列操作： 1.取反向序列 seqkit seq test.fa r test_re.fa 2.取互补序列 seq test.fa p test_com.fa 3.取反向互补序列 seqkit seq test.fa r p test_re_com.fa 4.DNA序列转换为RNA序列 seqk 阅读全文
posted @ 2019-02-23 10:25
记号晴
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摘要：
1.统计大于号开始的行数或seqkit 工具 Total sequence length 5,759,798,599 Total ungapped length 5,759,798,599 Number of contigs 1,397,492 Contig N50 9,587 Contig L50 阅读全文
posted @ 2019-02-22 21:30
记号晴
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摘要：
FASTA格式是一种用于记录序列的文本格式，在生信分析中经常会用到.fasta文件中往往储存成千上万条序列，而在某些时候，需要对文件进行分割，如分割成每个序列一个文件，或分割成较小的fasta文件 假如有如下数据： Tricas1.fasta $ head Tricas1.fasta CM00027 阅读全文
posted @ 2019-02-22 15:29
记号晴
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摘要：
用conda安装时它并没有注明是依赖于python3.6 但它会把anaconda默认python版本为3.6，无论是3.7还是2.7 且它不管以你是自己的环境还是公共的环境，都会升级 你不得不重装anaconda 阅读全文
posted @ 2019-02-22 12:30
记号晴
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摘要：
1 minimap2 的安装 2 Lighter 的安装 3 BESST 的安装 or 阅读全文
posted @ 2019-01-23 13:09
记号晴
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摘要：
1.尽量少赖床，5:30起来。这样不耽误打电话，六点叫起床，不然室友会吵到啊 2.英语要好好练，不能三天打鱼两天晒网的。要有规划 3.要静下心，不要焦躁。才研一，技术学好后才有机会找工作 4.按照目标职位来要求自己。 5.网上一半的信息是无效的，另25%是需要提炼的 6.要多沟通 阅读全文
posted @ 2019-01-20 12:35
记号晴
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摘要：
测序数据拿回来之后，会给一些数据。那么这些数据代表什么呢？ 1. 原始数据（Raw data）：一次测序产生的全部原始数据。理论上，它们应该是没有经过任何过滤的，无论好坏。 2. PF数据（PF data）：在测序过程中，Illumina内置软件根据每个测序片段（read，通常每个片段长100个碱基 阅读全文
posted @ 2019-01-07 14:16
记号晴
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