emanlee - 博客园

2011年6月7日

2011年春季软件项目管理实验安排

摘要：实验时： 1 携带实验报告纸(含实验报告纸首页；每次至少写5页报告；报告为手写)； 2 携带“Microsoft Office Project 2003 简体中文版”完整版（不要精简版），U盘。班级：软件081，软件082，计升本101，计升本102 课程：软件项目管理地点：计算机学院实验室/实验中心工具：Microsoft Office Project 2003 简体中文版 VSS6.0 VC6.0 VB6.0其他事项：一次一个自然班。尽量安排在白天，4学时连上（中间不休息）；如果排不开也可以排在晚上，或者排成2学时的。指导老师讲解和演示实验（投影仪），然后开始做实验。具体时间阅读全文

posted @ 2011-06-07 08:12 emanlee 阅读(311) 评论(0) 推荐(0)

2011年6月1日

Astra SiteManager

摘要： Astra SiteManager是一个全面的可视网站管理工具。它会扫描你的整个网站，用不同色彩对功能区域做标记，为你的网站呈现出一个完全的视觉图像。它可以察觉坏掉的联结和接入问题，把网站的最新变化和原来形成的镜像做比较，为提高网站的效率鉴别关键的使用模型，使动态生成的网页有效。 Astra SiteManager is a comprehensive, visual Website management tool that is designed to meet the challenges faced by Webmasters and business managers of rapid 阅读全文

posted @ 2011-06-01 20:20 emanlee 阅读(444) 评论(0) 推荐(0)

2011年5月29日

似然似然函数最大似然估计

摘要：似然“似然”是对likelihood 的一种较为贴近文言文的翻译．“似然”用现代的中文来说即“可能性”。似然函数设总体X服从分布P(x；θ)（当X是连续型随机变量时为概率密度，当X为离散型随机变量时为概率分布），θ为待估参数，X1,X2,…Xn是来自于总体 X的样本，x1,x2…xn为样本X1,X2,…Xn的一个观察值，则样本的联合分布（当X是连续型随机变量时为概率密度，当X为离散型随机变量时为概率分布） L（θ）=L（x1,x2,…,xn；θ）=ΠP（xi；θ）称为似然函数.最大似然估计我们可能不知道θ的值，尽管我们知道这些采样数据来自于分布D。那么我们如何才能估计出θ呢？一个自然的想法是阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:41 emanlee 阅读(3351) 评论(0) 推荐(0)

聚合酶链式反应简称PCR

摘要：定义聚合酶链式反应，其英文Polymease Chain Reaction(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。它不仅可用于基因分离、克隆和核酸序列分析等基础研究,还可用于疾病的诊断或任何有DNA,RNA的地方．聚合酶链式反应又称无细胞分子克隆或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增技术。工作原理类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火(复性）--延伸三个基本反应步骤构成：①模板DNA的变性：阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:23 emanlee 阅读(3209) 评论(0) 推荐(0)

遗传图谱 genetic map

摘要：定义：某一物种的染色体图谱（也就是我们所知的连锁图谱），显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。如果同一条染色体上的两个基因相对距离越长，那么他们减数分裂发生重组的概率将越大，共同遗传的概率也就越小。因此可以根据他们后代性状的分离可以判断他们的交换率，也就可以判断他们在遗传图谱上的相对距离。通过遗传重组所得到的基因在具体染色体上线性排列图称为遗传连锁图。它是通过计算连锁的遗传标志之间的重组频率，确定他们的相对距离，一般用厘摩(cM，即每次减数分裂的重组频率为1%)来表示。绘制遗传连锁图的方法有很多，但是在DNA多态性技术未开发时，鉴定的连锁图很少，随着DN 阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:22 emanlee 阅读(1616) 评论(0) 推荐(0)

什么是DNA微阵列技术？

摘要： DNA微阵列（DNA Microarray）也叫寡核苷酸阵列（Oligonucleitide array），是人类基因组计划（Human Geneome Project，HGP）的逐步实施和分子生物学的迅猛发展及运用的产物，它是生物学家受到计算机芯片制造和广为应用的启迪，融微电子学、生命科学、计算机科学和光电化学为一体，在原来核酸杂交（Northern、Southern）的基础上发展起来的一项新技术，它是第三次革命（基因组革命）中的主要技术之一，是生物芯片中的一种。该技术的原理是在固体表面上集成已知序列的基因探针，被测生物细胞或组织中大量标记的核酸序列与上述探针阵列进行杂交，通过检测相应位置杂阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:19 emanlee 阅读(5818) 评论(0) 推荐(0)

基因选择

摘要：微阵列数据广泛而成功地应用于生物医学的癌症分类研究.一个典型的微阵列数据集包含大量(通常成千上万 ,甚至数十万)的基因、相对少量(往往不足一百)的样本.在这成千上万的基因中 ,仅仅一少部分基因对癌症分类有贡献.因而,对于癌症分类来说,最重要的一个问题就是识别出对癌症分类最有贡献的基因.这一识别过程称为基因选择.基因选择在统计模式识别、机器学习和数据挖掘领域已得到广泛研究.基因微阵列数据通常包含大量与肿瘤分类无关的数据,会严重降低肿瘤诊断的准确率;基因微阵列数据还存在小样本、高维度的问题,也增加了肿瘤诊断的难度,所以必须对其进行基因选择。阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:18 emanlee 阅读(1135) 评论(0) 推荐(0)

LOD值 LOD score

摘要： LOD值 LOD score 定义：确定两个基因座是否在染色体上距离很近，因此可能一起遗传的统计学评估。三个或更多的LOD评价通常显示了两个基因座的位置很紧密。详解：遗传学上通常用或然率的常用对数作为标准的衡量方法，该值的对数值称为Lod值或对数优势比：根据两个非此即彼的假设，计算数据的整体或然性，以确定两个基因座或是按一定的重组率而相互连锁的可能性或是互不连锁的可能性；这两种可能性之比，是基因座实际上为连锁的可能性；这个比率的10作底的对数就是对数优势比。为了确定两对基因之间是否存在连锁，一般要求或然比大于1000：1，即Lod>3；而要否定连锁存在，则要求或然小于100：1，即Lo 阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:15 emanlee 阅读(6722) 评论(0) 推荐(0)

什么是SSLP和ISSR？

摘要：什么是SSLP和ISSR？简单序列长度多态性（simple sequence length polymorphism，SSLP）是据串联重复排列微卫星基序两侧的单一序列设计引物，对微卫星序列（microsatellite DNA或simple sequence repeats，SSR）进行扩增，由微卫星基序重复数目的变异而产生多态性。由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列，因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序，然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增，从而将单个微卫星位点扩增出来。由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异，个体的扩增产物在长度上阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:12 emanlee 阅读(1201) 评论(0) 推荐(0)

ROC曲线的意义

摘要： ROC曲线的意义 ROC曲线指受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve), 是反映敏感性和特异性连续变量的综合指标,是用构图法揭示敏感性和特异性的相互关系，它通过将连续变量设定出多个不同的临界值，从而计算出一系列敏感性和特异性，再以敏感性为纵阅读全文

posted @ 2011-05-29 20:10 emanlee 阅读(10491) 评论(0) 推荐(0)