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摘要: 模拟退火算法来源于固体退火原理,将固体加温至充分高,再让其徐徐冷却,加温时,固体内部粒子随温升变为无序状,内能增大,而徐徐冷却时粒子渐趋有序,在每个温度都达到平衡态,最后在常温时达到基态,内能减为最小。 模拟退火算法(Simulated Annealing,SA)最早由Kirkpatrick等应用于组合优化领域,它是基于Monte-Carlo迭代求解策略的一种随机寻优算法,其出发点是基于物理中固体... 阅读全文
posted @ 2011-07-31 14:50 emanlee 阅读(53573) 评论(0) 推荐(1)
摘要: http://blog.csdn.net/casularm/article/details/2793747 阅读全文
posted @ 2011-07-30 21:51 emanlee 阅读(1909) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 众数(Mode)统计学名词,在统计分布上具有明显集中趋势点的数值,代表数据的一般水平(众数可以不存在或多于一个)。 修正定义:是一组数据中出现次数最多的数值,叫众数,有时众数在一组数中有好几个。用M表示。 理性理解:简单的说,就是一组数据中占比例最多的那个数。 http://baike.baidu.com/view/170875.htm 阅读全文
posted @ 2011-07-24 20:42 emanlee 阅读(847) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 直线回归的概念 直线回归(linear regreSSion)是用直线回归方程表示两个数量变量间依存关系的统计分析方法,属双变量分析的范畴。如果某一个变量随着另一个变量的变化而变化,并且它们的变化在直角坐标系中呈直线趋势,就可以用一个直线方程来定量地描述它们之间的数量依存关系,这就是直线回归分析。 直线回归分析中两个变量的地位不同,其中一个变量是依赖另一个变量而变化的,因此分别称为因变量(depe... 阅读全文
posted @ 2011-07-24 19:50 emanlee 阅读(2150) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 海龟很能喝,某天却喝醉了,朋友问:你怎么还会喝醉?海龟:唉,章鱼那孙子非要和爷划拳,那么多手,晕得我看都看不过来,输惨了! 同学在老家当防暴警察,头一次执行任务是一次民工讨薪聚众闹事。防暴警出动,第一排盾牌,第二排警棍,第三排拿枪。朋友等新人在第四排喊话摄像。 开始喊话,领导让新人喊,新人拿起喇叭:你们已经被包围了!队长飞起来踹了喊话的一脚,抢过喇叭喊:你们要相信党,相信政府。 家住农村的司机为了... 阅读全文
posted @ 2011-07-17 22:28 emanlee 阅读(463) 评论(0) 推荐(0)
摘要: rasmol软件简介及详细使用说明: 目前在结构生物学领域有许多图形显示的程序,每个都有自己不同的特点。可能很多人知道rasmol,除了图形界面中的一些功能外,该程序的命令行方式有着很强大的功能。下面将介绍一些常用的使用方法。 Rasmol(http://www.openrasmol.org/)程序有多种版本,有unix, windows, Mac等。另外还有一个windows和linux版本ht... 阅读全文
posted @ 2011-07-17 20:58 emanlee 阅读(8775) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 最大期望算法(Expectation-maximization algorithm,又译期望最大化算法)在统计中被用于寻找,依赖于不可观察的隐性变量的概率模型中,参数的最大似然估计。 在统计计算中,最大期望(EM)算法是在概率(probabilistic)模型中寻找参数最大似然估计或者最大后验估计的算法,其中概率模型依赖于无法观测的隐藏变量(Latent Variable)。最大期望经常用在机器... 阅读全文
posted @ 2011-07-04 20:55 emanlee 阅读(2470) 评论(0) 推荐(0)
摘要: In genetics, complementary DNA (cDNA) is DNA synthesized['sinθisaiz] from a mature mRNA template in a reaction catalyzed['kætəlaiz] by the enzyme reverse transcriptase and the enzyme DNA polymerase. c... 阅读全文
posted @ 2011-07-03 21:58 emanlee 阅读(477) 评论(0) 推荐(0)
摘要: from Tkinter import * root = Tk() root.mainloop()运行出现错误:>>> Traceback (most recent call last): File "E:/××××/Python/test", line 1, in f... 阅读全文
posted @ 2011-07-01 17:38 emanlee 阅读(5121) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 以前上课学的C/C++/Java/C#/汇编 。自学的perl/python/matlab/R/等等。其实用什么语言搞科研主要看老板,我最初老板和组里其他人都用perl,我也学perl。这样方便大家交换程序。现在的老板用python,我就开始学python了。其实觉得bioinformatics的本科都会教c或者java,会了c/java其中任何一个,再学perl或者python或者matlab就都是非常容易的。现在这个领域里用的最多的我觉得是python,正在慢慢取代perl。matlab因为不免费,流行不广不如python,perl,java。但是我觉得确实最方便最适合搞计算方面研究的(如 阅读全文
posted @ 2011-07-01 16:28 emanlee 阅读(9907) 评论(2) 推荐(2)
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