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摘要: 解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度 Identities 一致性,就是两个序列有多少是一样的 Query 代表输入序列... 阅读全文
posted @ 2011-11-11 10:48 emanlee 阅读(4576) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 安装Randfold 软件下载:http://bioinformatics.psb.ugent.be/supplementary_data/erbon/nov2003/ 安装:tar zxvf randfold.tar.gz cd randfold-2.0 make cp randfold /usr/local/bin ... 阅读全文
posted @ 2011-11-11 10:39 emanlee 阅读(1751) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 问题: ubuntu没有权限(不能)创建文件夹(目录),怎么没权限呢?我可是administrator?! 方法: 可以在终端直接运行 sudo nautilus ,弹出来的nautilus可以直接GUI操作,中途别关终端。 阅读全文
posted @ 2011-11-10 22:38 emanlee 阅读(2779) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 查看软件xxx安装内容 dpkg -L xxx 查找软件库中的软件 apt-cache search 正则表达式 查找软件库中的软件 aptitude search 软件包 查找文件属于哪个包 dpkg -S filename 查找文件属于哪个包 apt-file search filename 查询软件xxx依赖哪些包 apt-ca... 阅读全文
posted @ 2011-11-10 22:26 emanlee 阅读(843) 评论(0) 推荐(0)
摘要: I am running ubuntu on Vmware and have a local folder mapped so the virtual machine can access the files. The "real" files are localed under D:/something and appear in Ubuntu uder root/mnt/hgfs/someth... 阅读全文
posted @ 2011-11-10 22:15 emanlee 阅读(3284) 评论(0) 推荐(0)
摘要: mkdir 目录名创建一个目录 rmdir 空目录名删除一个空目录 rm 文件名文件名删除一个文件或多个文件 rm –rf 非空目录名删除一个非空目录下的一切 touch 文件名创建一个空文件 重命名文件夹 执行格式: mv source destination Example: mv file1 file2 将文件 file1,更改文件名为 file2。 mv file1 dir1... 阅读全文
posted @ 2011-11-10 12:16 emanlee 阅读(16108) 评论(0) 推荐(0)
摘要: ECHO命令是大家都熟悉的DOS批处理命令的一条子命令,但它的一些功能和用法也许你并不是全都知道,不信你瞧: 1. 作为控制批处理命令在执行时是否显示命令行自身的开关 格式:ECHO [ON|OFF] 如果想关闭“ECHO OFF”命令行自身的显示,则需要在该命令行前加上“@”。 2. 显示当前ECHO设置状态 格式:ECHO 3. 输出提示信息 格式:ECHO信息内容 上述是EC... 阅读全文
posted @ 2011-11-10 09:25 emanlee 阅读(41516) 评论(0) 推荐(0)
摘要: vi/vim 基本使用方法 vi编辑器是所有Unix及Linux系统下标准的编辑器,它的强大不逊色于任何最新的文本编辑器,这里只是简单地介绍一下它的用法和一小部分指令。由于对Unix及Linux系统的任何版本,vi编辑器是完全相同的,因此您可以在其他任何介绍vi的地方进一步了解它。Vi也是Linux 阅读全文
posted @ 2011-11-10 08:42 emanlee 阅读(142975) 评论(5) 推荐(7)
摘要: root 用户和 sudo 命令 GNU/Linux 系统的 root 用户具有系统的管理权限。出于安全考虑,普通用户并不具备这一权限。不过,Ubuntu 上并不包含 root 用户,而是将管理员权限授予特定用户,他们可以使用 "sudo" 应用程序来执行管理任务。默认情况下,在您的系统安装过程中创建的第一个用户帐号具有使用 sudo 的权限。您可以通过用户和组来限制和赋予用户运行 sudo 的... 阅读全文
posted @ 2011-11-10 08:25 emanlee 阅读(2754) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 在Linux里设置环境变量的方法(export PATH) 一般来说,配置交叉编译工具链的时候需要指定编译工具的路径,此时就需要设置环境变量。例如我的mips-linux-gcc编译器在“/opt/au1200_rm/build_tools/bin”目录下,build_tools就是我的编译工具,则有如下三种方法来设置环境变量: 1、直接用export命令: #export PA... 阅读全文
posted @ 2011-11-09 23:41 emanlee 阅读(632) 评论(0) 推荐(0)
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