rdkit Mol调用Get_Atoms()获取原子的顺序并不一定与inchi标号相符,甚至使用Chem.CanonicalRankAtoms来进行原子标号也不一定可以解决这个问题。这时需要使用Chem.MolToInchiAndAuxInfo()的方式来获取额外信息来进行位置的匹配。
一个分子
使用自然顺序标号
获取辅助信息
获得映射