rdkit 原子顺序与inchi原子位置

rdkit Mol调用Get_Atoms()获取原子的顺序并不一定与inchi标号相符,甚至使用Chem.CanonicalRankAtoms来进行原子标号也不一定可以解决这个问题。这时需要使用Chem.MolToInchiAndAuxInfo()的方式来获取额外信息来进行位置的匹配。

 

一个分子

使用自然顺序标号

获取辅助信息

获得映射

posted @ 2021-05-27 17:27  e-yi  阅读(90)  评论(0)    收藏  举报  来源