摘要：
为了确定爬虫文件输出格式整理的，不完整。 %0 refernce type (e.g. Journal Article) %T title %J journal %D year %A author %F label %K keywords %N issue %P page %R DOI %U URL 阅读全文
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torch.cat((TensorA,TensorB))在连接两个不同类型的Tensor的时候会发生类型转换，转换表如下 表的行列按照优先级排列 需要注意的是这个优先级可能会导致数据的溢出，如 [In] torch.cat((torch.LongTensor([1<<31]),torch.HalfT 阅读全文
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key words: pytorch, dataloader, multiprocessing 问题描述 Dataset输入是一组对象，每个对象可以产生20-3000个训练样本。使用IterableDataset，用迭代的方式从每个对象中产生样本。为了支持多进程，预计算了每个对象会产生的样本数，使得 阅读全文
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rdkit Mol调用Get_Atoms()获取原子的顺序并不一定与inchi标号相符，甚至使用Chem.CanonicalRankAtoms来进行原子标号也不一定可以解决这个问题。这时需要使用Chem.MolToInchiAndAuxInfo()的方式来获取额外信息来进行位置的匹配。 一个分子 使 阅读全文
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rdkit 会在KeKulize的时候清除键上的芳香环信息，但是输出smiles重新导入后会恢复该信息 mol = Chem.MolFromSmiles('c1ccccc1') Chem.Kekulize(mol,False) print(mol.GetBondWithIdx(0).GetIsAro 阅读全文
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from collections import defauldict a = defaultdict(lambda: len(a)) # a dict with auto increasing value def inc(i=-1): def f(): nonlocal i i+=1 return 阅读全文
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基本来自官方文档的示例https://docs.python.org/zh-cn/3/library/heapq.html (3.9.1) 使用entry_finder索引所有存在的项目 当从堆中去除某个项时，仅把该项（的task）标作REMOVED 更新时使用add_task函数输入原task和新 阅读全文
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使用NNI进行自动超参数调优 有中文文档 NNI (Neural Network Intelligence) 是一个工具包，可有效的帮助用户设计并调优机器学习模型的神经网络架构，复杂系统的参数（如超参）等。 NNI 的特性包括：易于使用，可扩展，灵活，高效。 易于使用：NNI 可通过 pip 安装。 阅读全文
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einops 通过灵活而强大的张量操作符为你提供易读并可靠的代码。 支持 numpy、pytorch、tensorflow 以及其他框架 In case you need convincing arguments for setting aside time to learn about einsu 阅读全文
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# pytorch 1.6 目前pytorch.fft没有支持复数数据类型，如果支持就好写很多了 # 当onesided为True时，依据输入张量的嵌入维度奇偶性，可能出现维度不匹配的问题 from einops impor rearrange def ccorr(a, b, sigdim=1, o 阅读全文