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sentinel SNP 和 Tag Snp 的概念

橙子牛奶糖 2021-12-04 18:38 阅读:1034 评论:0 推荐:1

一行命令批量修改染色体和位置为RS号

橙子牛奶糖 2021-11-30 21:04 阅读:2538 评论:11 推荐:2

使用 PLINK 把 vcf 的0/0,0/1,1/1转为字母格式的基因型(比如AA,AG,GG)

橙子牛奶糖 2021-09-10 20:38 阅读:946 评论:5 推荐:2

批量注释基因到基因座上(map gene to locus)

橙子牛奶糖 2021-09-06 20:54 阅读:680 评论:0 推荐:1

post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization)

橙子牛奶糖 2021-07-23 20:03 阅读:6545 评论:1 推荐:1

使用 FUMA 鉴定 Independent SNPs 和 Lead SNPs

橙子牛奶糖 2021-06-19 02:16 阅读:1645 评论:0 推荐:2

基于 MAGMA 的 gene-based 关联分析研究

橙子牛奶糖 2021-04-07 18:09 阅读:3638 评论:4 推荐:1

无亲缘关系为何IBD结果为同卵双胞胎/重复样本

橙子牛奶糖 2021-03-23 20:40 阅读:489 评论:0 推荐:1

beta/or, se, p, zscore换算总结帖（20211014更新）

橙子牛奶糖 2021-03-04 22:52 阅读:42296 评论:5 推荐:3

(史上最全)SNP位点与转录因子结合特异性数据库：GVATdb

橙子牛奶糖 2021-02-05 20:53 阅读:1349 评论:0 推荐:1

孟德尔随机化(Mendelian Randomization) 统计功效（power）和样本量计算

橙子牛奶糖 2021-01-08 19:04 阅读:8850 评论:2 推荐:1

Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)

橙子牛奶糖 2020-12-18 20:33 阅读:6233 评论:2 推荐:1

感兴趣的SNP/区域上是否有增强子/转录因子？增强子/转录因子调控哪个靶基因？（EnhancerDB）

橙子牛奶糖 2020-11-24 19:53 阅读:943 评论:0 推荐:2

基于GCTA的gene-based关联分析研究

橙子牛奶糖 2020-11-23 19:31 阅读:1259 评论:2 推荐:1

一次性计算多个表型的遗传相关性(LDSC, GCTA)

橙子牛奶糖 2020-10-23 20:11 阅读:3814 评论:0 推荐:2

SNP x SNP 上位效应（epistasis）分析

橙子牛奶糖 2020-10-14 11:45 阅读:2632 评论:0 推荐:1

多文解读：多基因分险得分（Polygenic risk score，PRS）应用

橙子牛奶糖 2020-09-26 17:59 阅读:2653 评论:0 推荐:1

推荐一个画连锁不平衡图（LD block）的软件LDBlockShow，亲测比haploview好用！

橙子牛奶糖 2020-08-18 23:20 阅读:10195 评论:3 推荐:3

一个R包(IntAssoPlot)，LocusZoom图、连锁不平衡图和基因结构图一步到位

橙子牛奶糖 2020-08-12 20:05 阅读:3755 评论:5 推荐:2

讲一讲孟德尔随机化分析中的敏感性分析（sensitivity analyses）

橙子牛奶糖 2020-07-30 16:21 阅读:17705 评论:2 推荐:1