千人基因组计划数据库下载某段区域SNP

下载vcf文件:

方法一:进入ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/release/20130502/,直接下载相应染色体的vcf

方法二:进入http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/DataSlicer

 

假定要寻找“6:133098746-133108745”这段距离的SNP数据,“6”表示6号染色体,后面的数据表示距离。

按下图所示操作:

 

点击“run”,进入如下界面后,再点击“view results”

 

弹出如下界面,再点击“Download results file”。即可得到我们要的结果

 下载map文件和ped文件:

进入链接

 

点击后,弹出如下界面:

接着下载info文件和map文件:

 

posted @ 2016-09-08 17:07  橙子牛奶糖  阅读(6709)  评论(7编辑  收藏  举报