解决方案:使用QTLtools进行表型PCA分析,得到了一堆NA
使用QTLtools进行表型的PCA分析时,得到了一堆NA,如下所示:

思前想后,觉得问题应该是出现在表型上,我的表型有NA值,如下所示:

可能是QTLtools进行PCA分析时,不接受NA值(我猜的),于是把所有有NA的表型均剔除了,重新进行PCA分析,结果如下所示:

OK,PCA结果出来了,我真聪明。
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