BPSO_Mynotes

摘要： 用Li Heng开发的Minimap+miniasm进行组装，然后用racon+pilon进行纠错。 三代测序拼装软件，三代测序平台 Nanopore / Pacbio 产生的数据的一个共同点就是，读长长，错误率高，在用于分析之前需要对数据进行特殊处理（consensus，纠错），再进行拼装任务，L 阅读全文

摘要： ALCON是PacBio公司开发的一款用于三代基因组De novo组装软件, 更适合于大基因组的组装。 FALCON的结果文件： 阅读全文

摘要： 这个问题很明显的需要用枚举的思想来一一遍历数组元素并进行无重复组合 给出一个数组a[14]={1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14}，求从中任取n个元素的所有组合 如果任取1个元素+取所有元素：15种可能 如果任取2个元素：C^2 14=91 递归组合 1 2 1 3 1 阅读全文

摘要： 单行复制 在命令模式下，将光标移动到将要复制的行处，按“yy”进行复制 在命令模式下，将光标移动到将要粘贴的行处，按“p”进行粘贴 参考资料： https://www.cnblogs.com/EasonJim/p/8320776.html 阅读全文

摘要： 原文件名为file1.txt，压缩后原文件消失，压缩后文件名为file1.txt.gz gzip file1.txt 压缩两个文件到一个文件 cat file1.txt file2.txt | gzip > foo.gz 或 gzip -c file1.txt file2.txt > foo.gz 阅读全文

摘要： RS II Sequel 在下机文件中，主要有三类文件，bam 文件，bam.pbi 文件，以及xml文件。当我们习惯性的去寻找熟悉的fastq格式文件做分析时，发现找不到了，因为在sequel平台中bam 文件成为了它的替代者，因为其更节约储存空间。这是文件格式的一个重大更新。用于后续分析的文件一 阅读全文

摘要： 相较于其他三代四代数据组装软件（Canu（也可用于纠错），smartdenovo，miniasm，Flye，TULIP，FALCON，FALCON-unzip等） wtdbg有如下优点： 安装运行简单 (可用run_wtdbg_assembly.sh脚本生成运行脚本)，运行速度快, 运行内容：一步组 阅读全文

摘要： 查看glibc版本 64bit：strings /lib64/libc.so.6 |grep GLIBC 查看glib安装版本 rpm -qa | grep glib 参考来源： https://blog.csdn.net/u013992330/article/details/74011601 ht 阅读全文

摘要： cat /etc/issue 或 cat /etc/redhat-release 参考来源：https://www.cnblogs.com/rsty/p/10443680.html 阅读全文

摘要： awk -F '-' '{print $1;}' data Shell 将两个文件按列合并 需要把file2的第二列合并到file paste -d " " file1 file2 删除文件 text中第一列 awk '{$1="";print $0}' text 参考来源： https://blo 阅读全文