（四）文件查看：查看（cat、less）、文本搜索（grep）、覆盖写入（>）、合并（cat+>）

1. 文件查看：cat命令、less命令

# cat命令不适合大文件
cat

# less命令直接打开大文件
less -N                          // -N 显示行号
less -N -S                       // -S 不换行，左右翻页
# 在打开的页面进行搜索
/keyword                         // 回车

# head命令查看文件的前10行
head -n 3                        // 显示前3行，-n后面必须加数字

# tail命令查看文件的后几行

快捷键：

1. 终止进程：ctrl + C
2. 退出：q
3. 搜索：/

2. 文本搜索：grep 命令

# grep 命令
grep ">" atha.fasta                    // 双引号里的字段匹配，结果打印出来标红
grep ">" atha.fasta | wc               // 查看文件中的序列有多少行。（筛选所有含有>的行）
grep -c ">" atha.fasta

# sort 排序
# uniq 去重
grep ">" gmax.fasta | sort | uniq | wc
grep ">" gmax.fasta wc                 // 两者比较，相同，则没有重复序列

3. 重定向>、追加>>、管道|

# > 文件（覆盖）写入
head -n 10 atha.fasta > head10.fasta # 把文件前10行提取，放入另一个文件

# >> 文件追加
tail -n 10 atha.fasta >> head10.fasta

# | 文件传送
head -n 500 atha.gff | tail -n 101 >subset.gff # 提取序列400-500行，输入到新文件 

# wc 在默认的情况下，wc将计算指定文件的行数、字数，以及字节数
wc 
    -l, --lines：显示行数；
    -w, --words：显示字数；
    -m, --chars：显示字符数；
    -c, --bytes：显示字节数；
    -L, --max-line-length：显示最长行的长度。

4. 合并文件（cat+>）

cat atha.fasta amax.fasta sind.fasta >all.fasta