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2026年5月2日
物种的栖息温度信息下载(GBIF—OBIS—WOA2018)
摘要: 一、下载物种的经纬度、水深 # 查物种的taxonKey library(rgbif) name_backbone(name="Akarotaxis nudiceps") # 1.从gbif下载 gbif_download <- occ_download(pred_default(),pred("t
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posted @ 2026-05-02 00:57 asaca_r
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2026年5月1日
rgbif的使用
摘要: 生物分布数据库 GBIF:全球生物多样性信息平台,收集全球生物在哪里被发现的点位数据 OBIS:海洋生物多样性信息系统,专门管海洋生物的分布点位 一、注册 # 到官网注册后,设置账号密码邮箱,存到R的环境配置文件(.Renviron)中 install.packages("usethis") use
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posted @ 2026-05-01 13:28 asaca_r
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2026年4月28日
R基础(五):tidyverse
摘要: library(tidyverse) 一、数据类型 Tibble 1. 读取dataframe # data.frame gene_exp_df <- read.delim("data/R_basic/gene_exp.txt", row.names=1) 2. 读取tible # tibble l
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posted @ 2026-04-28 01:55 asaca_r
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R基础(四):导入数据,保存数据、对象和图片
摘要: 1. 输入 # 导入数据 gene_exp <- read.table("data/R_basic/genes.TMM.EXPR.matrix", header = T,row.names=1) gene_exp[1:3,1:3] 2. 输出 # 保存数据 write.table(gene_exp,
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posted @ 2026-04-28 00:54 asaca_r
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R基础(三):数据类型(数值、字符、逻辑)
摘要: 一、数值型 numeric # 数值型 numeric a <- c(2,-2,9.55) b <- c(4,1,-6.2) class(a) [1] "numeric" 计算 # 四舍五入 round(a,1) [1] 2.0 -2.0 9.6 abs(a) # 绝对值 [1] 2.00 2.00
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posted @ 2026-04-28 00:31 asaca_r
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2026年4月27日
R基础(二):数据结构(向量、数据框)
摘要: 新建项目 # 获取工作目录 > getwd() [1] "D:/R_project/R_basic" # ?+函数名,获取帮助文档 > ?getwd 快捷键:ctr+l清空屏幕 一、向量 2.1 创建变量 # 创建向量 a <- c(4, 6, 0, 8, 1) b <- 4 # 相当于c(4),R
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posted @ 2026-04-27 23:36 asaca_r
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2026年4月26日
Rstudio改为全英环境
摘要: 安装R-base时,语言选择English,不勾选Message translation 求教Rstudio 如何切换为全英文的环境 - COS论坛 | 统计之都 | 统计与数据科学论坛
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posted @ 2026-04-26 16:19 asaca_r
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2026年4月15日
文献检索:知网、万方、句子检索
摘要: 一、知网检索规则 逻辑运算符:* + -(右侧有提示,不用记) *:相当于and +:相当于or -:相当于- 运算顺序:检索框从上往下 主题词查找:CBM(SinoMed,中国生物医学文献库):https://www.sinomed.ac.cn/zh/ 中文期刊: SCI:被 Science Ci
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posted @ 2026-04-15 20:33 asaca_r
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文献检索:Web of Science的使用
摘要: wos不提供全文,仅提供标题、摘要、引文等信息,提供全文链接 一、检索规则 逻辑运算符:AND OR NOT 不区分大小写 优先级NOT>AND>OR 括号改变运算顺序 通配符 *:任意字符。n≥0。 biolog*: biology, biological ?:任意单个字符。n=1。wom?n:
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posted @ 2026-04-15 16:47 asaca_r
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文献检索:pubmed的使用
摘要: 查准:使用规范的主题词 查全:款目词(与主题词同义或相关),下位词,通配符扩展(形容词名词单复数英式美式) 一、结果页面 1.1 pubmed文献条目 1.2 全文链接 官网:机构有权限/个人付费获取 PMC:站内直接获取阅读 其他全文获取途径:复制doi号到sci-hub sci-hub 可用网址
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posted @ 2026-04-15 00:53 asaca_r
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