Yuan-SW-F(abysw) - 博客园

【软件安装】重测序注释——snpEff 的使用

摘要：下载软件包： https://pcingola.github.io/SnpEff/ # 软件网址 snpEff_latest_core.zip # 软件名解压到指定文件夹： unzip snpEff_latest_core.zip # 于指定文件夹解压 cd snpEff # 进入snpEff文件阅读全文

posted @ 2021-08-05 22:47 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(597) 评论(0) 推荐(0)

【声明】本博客所有内容为原创，若想转载，请与作者公众号联系

摘要：突然发现我的文章出现在其他网站上，并且还标明着原创，下面还明晃晃有“打赏”二字。鄙人文章大部分都是自己捣鼓的，且未发表内容，发布只是为了交流分享，和工作学习记录，想要查看可以直接来公众号。早上就“ 生物信息-McScan（Python-jcvi）共线性画图 ”一篇文章，发现了四个搬运工，有的已经阅读全文

posted @ 2021-07-22 12:43 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(64) 评论(0) 推荐(0)

【软件安装】xterm

摘要： https://centos.pkgs.org/7/centos-updates-x86_64/xterm-295-3.el7_9.1.x86_64.rpm.html yum install xterm 阅读全文

posted @ 2021-07-13 18:57 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(116) 评论(0) 推荐(0)

在开启防火墙的情况下设置共享文件夹

摘要：上回说到设置共享文件夹需要关闭防火墙： service iptables stop 或 systemctl stop firewalld 但是由于网络安全的问题，我们需要保持防火墙开启，如此便引入了新的问题：打开防火墙后，会产生报错信息： clnt_create: RPC: Port mapper 阅读全文

posted @ 2021-07-08 15:38 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(956) 评论(0) 推荐(0)

【公告】github数据迁移到gitee

摘要：由于最近github持续抽风，鄙人将之前的github（Yuan-SW-F）进行了gitee迁移。以前路径为：https://github.com/Yuan-SW-F 当前路径为：https://gitee.com/Yuan-SW-F 今后新工具和流程将优先在gitee上更新，并对成熟版本的文档进阅读全文

posted @ 2021-06-23 17:41 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(162) 评论(0) 推荐(0)

设置共享文件夹

摘要： $ cat /etc/exports/path 192.168....(rw,sync,no_root_squash,no_all_squash) $ service nfs restart $ mount 192.168....:/path abyss 有报错： mount.nfs: No rou 阅读全文

posted @ 2021-06-03 11:00 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(67) 评论(0) 推荐(0)

R安装

摘要：就很奇怪，R的安装总是会有一定的问题。项目需求：画地图本次下载的是R 3.5.3版本。 yum -y update nss # 若有 curl: (35) SSL connect error 报错时安装ggplot2，install.packages("ggplot2", repos = "h 阅读全文

posted @ 2021-06-02 15:32 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(131) 评论(0) 推荐(0)

MySQL安装

摘要： yum -y install mariadb-server mariadb $ systemctl start mariadb # 启动 $ systemctl enable mariadb # 开机启动 $ mysql_secure_installation # 安全配置登录： $ mysql 阅读全文

posted @ 2021-05-21 09:46 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(44) 评论(0) 推荐(0)

作业系统补充-一些BUG的最终处理

摘要：由于投任务的问题，又回头看了很多PBS的东西，看看任务为什么down，为什么Q，为什么C。现在总结一下： 1. maui系统我最终还是没用上（虽然装上了），怎么装的就不讲了，很多博客都有，找了很久的资源，我先给个链接。坑有不少，但是我觉得不用躺进去，有问题可以直接留言。 2. Q状态找了一些情况，阅读全文

posted @ 2021-04-24 01:03 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(85) 评论(0) 推荐(0)

ERR处理：GATK java 内存报错

摘要： -Xmx512M 阅读全文

posted @ 2021-04-21 09:30 Yuan-SW-F(abysw) 阅读(204) 评论(0) 推荐(0)

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