IQ-tree绘制进化树3-验证

验证进化树构建状态

1、在输出目录看.log文件是否继续更新，查看最后几行

tail <.log>

若输出结果最后如下则表示程序成功完成
Analysis completed.
Best-scoring ML tree written to: ...

2、查看 .iqtree 文件

tail your_run_name.iqtree

结尾有Overall running time: ...

3、检查CPU情况，iqtree是否还在消耗CPU

top

看是否有一个 iqtree2 进程在占用较高 CPU（如 300% 表示 3 核心在跑）

4、看后台是否还在运行

ps aux | grep iqtree

如果输出中有一条包含 iqtree2 -s xxx.fasta 这样类似的命令，说明还在运行中