GATK bundle 数据下载

GATK 在官网中提供了resource bundle，里面包含了所需要的很多数据。目前提供FTP 和 Google Cloud bucket 2种下载方式，由于用不了Google，推荐使用FTP

GATK官网推荐使用lftp工具进行访问ftp和下载数据，提前安装lftp，本次使用root 权限安装
yum -y install lftp #Redhat 系列

进入bundle:
lftp ftp://gsapubftp-anonymous@ftp.broadinstitute.org/bundle/
密码为空的，直接敲回车

 

 get 命令： 选择文件
mget 命令： 通配符
mirror 命令：下载文件夹
mirror hg38