2020年5月11日

摘要:Ctrl+Enter;有强制复制作用 http://www.360doc.com/content/19/0430/20/38017100_832588674.shtml 一、填充文本 二、填充公式 三、定位填充 四、不连续填充 阅读全文
posted @ 2020-05-11 12:33 0820LL 阅读(251) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:http://blog.sina.com.cn/s/blog_48e0ae280100nc7j.html 方法一 使用if语句和辅助列的方法 方法二 键盘操作:选择区域 --> 定位 --> 空值 --> Ctrl+Enter 阅读全文
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2020年4月27日

摘要:基础部分:Numpy Scipy matplotlib pandas pyMysql 机器学习:scikit-learn xgboost 框架:tensorflow pytorch爬虫:lxml beautifulsop request自然语言处理:jieba NLTK Gensim 阅读全文
posted @ 2020-04-27 12:43 0820LL 阅读(121) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:NLTK 大概是最知名的Python自然语言处理工具了,全称"Natural Language Toolkit", 诞生于宾夕法尼亚大学,以研究和教学为目的而生,因此也特别适合入门学习。NLTK虽然主要面向英文,但是它的很多NLP模型或者模块是语言无关的,因此如果某种语言有了初步的Tokenizat 阅读全文
posted @ 2020-04-27 11:52 0820LL 阅读(117) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年11月4日

摘要:从 python 第三方库列表下载安装包 https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ 然后使用 pip 进行安装 软件会自动安装到 python 安装路径的 scripts 目录下 使用 方法一 双击这两个应用程序 方法二 python -m IPytho 阅读全文
posted @ 2019-11-04 17:12 0820LL 阅读(102) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:在pypi中搜索相应的模块 直接使用 pip install 包名 的方法安装 下载第三方安装包 下载地址:https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ 根据系统 python版本下载相应的安装包 进入安装包的存放路径 然后使用 pip 进行安装 测试 阅读全文
posted @ 2019-11-04 16:05 0820LL 阅读(110) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年10月22日

摘要:Sevlet 下载pdf文件 支持中文文件名 部署描述符 阅读全文
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2019年10月21日

摘要:第一步 下载并安装 Python 并将Python 添加到环境变量中 第二步 下载并安装 VSCode 官网下载即可 第三步 安装插件 第四步 选择一个Python解释器 在 VSCode 中,通过打开命令选项板(Ctrl+Shift+P)选择Python3解释器。 开始键入 python,选择 I 阅读全文
posted @ 2019-10-21 17:30 0820LL 阅读(117) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年10月18日

摘要:以安装pandas为例: 如:pip install scrapy 时出现: error: Microsoft Visual C++ 14.0 is required. Get it with “Microsoft Visual C++ Build Tools”: http://landinghub 阅读全文
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2019年10月16日

摘要:调用库 获取 Path 的文件名 Path.name 参考 https://blog.csdn.net/amanfromearth/article/details/80265843 阅读全文
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摘要:参考下面教程 有空再整理 https://jingyan.baidu.com/article/7082dc1cd77899e40b89bd5a.html http://www.360doc.com/content/19/0614/23/7669533_842507326.shtml 【科研猫·绘图】 阅读全文
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摘要:下载 AI 的破解版 我这里用的是 Adobe_Illustrator CC 2019 Lite 精简特别版 V23.0.2 简体中文版 64位 安装略 新建文档 通常是 A4 图形绘制 选择 矩形工具,新建一个矩形,然后使用 移动工具 移动这个矩形 使用 文字工具,在这张图上新建文字,命名为 Fi 阅读全文
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2019年10月15日

摘要:jinja2 是 Flask 作者开发的一个模板系统,起初是仿 django 模板的一个模板引擎,为Flask提供模板支持,由于其灵活、快速、安全等优点被广泛使用。 官网:https://pypi.org/project/Jinja2/ 下载安装:pip install Jinja2 jinja2 阅读全文
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2019年10月14日

摘要:package test_java; import java.io.BufferedReader; import java.io.File; import java.io.FileOutputStream; import java.io.FileReader; import java.io.IOException; import java.util.Arrays; import jav... 阅读全文
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2019年10月13日

摘要:GEOquery 是 bioconductor 项目下的一个R包 官网:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GEOquery.html 下载安装: GEO 是由NCBI负责维护的一个数据库,期初是有芯片数据,后来增加了甲基化芯 阅读全文
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摘要:下载安装 affy 包为 Bioconductor 之中一个用于数据预处理的包。 affy 包的功能只有一个:读取 affymetrix 的基因表达芯片数据,即CEL格式文件,然后处理成表达矩阵。 先解释以下为什么这个包叫这个名字,这是因为affy其实是一个生产芯片的公司,这个公司做的芯片所产生的的 阅读全文
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2019年10月12日

摘要:apply() 函数算是R语言中很基础的一个函数,同时还有 sapply() lapply() tapply() 函数精简了 apply() 函数的用法。 apply() 函数是一个很R语言的函数,可以起到很好的替代冗余的for循环的作用,R语言中的循环操作for和while都是基于R语言本身来实现 阅读全文
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摘要:对于继承自己的class,父类可以认为他们都是自己的子女,而对于和自己都在同一个目录下的class,可以认为都是自己的朋友。 public:对所有用户开发,所有用户都可以直接调用 private:自己私有。除了自己之外,任何人都不可以直接使用。 protected:对于子女、朋友来说,是public 阅读全文
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2019年10月11日

摘要:何为功能富集分析? 功能富集分析是将基因或者蛋白列表分成多个部分,即将一堆基因进行分类,而这里的分类标准往往是按照基因的功能来限定的。换句话说,就是把一个基因列表中,具有相似功能的基因放到一起,并和生物学表型关联起来。 何为GO和KEGG? 为了解决将基因按照功能进行分类的问题,科学家们开发了很多基 阅读全文
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2019年10月10日

摘要:setwd("GSE29431_RAW") # 进入目录 fileNames <- list.files() # 获取目录下的所有文件sapply(fileNames, gunzip) # 进行解压操作,fileNames是一个向量,gunzip是解压缩的函数,sapply()会依次将fileNames中的元素应用gunzip函数 阅读全文
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摘要:代码如下 阅读全文
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2019年10月8日

摘要:将 html 转为 pdf :wkhtmltopdf wkhtmltopdf 是一个使用 webkit 网页渲染引擎开发的用来将 html 转成 pdf 的工具,可以跟多种脚本语言进行集成来转换文档。 官网:https://wkhtmltopdf.org/ github网址:https://gith 阅读全文
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2019年9月23日

摘要:R 语言的参数传递是按照引用传递的,二者共享内存 如果想要按值传递 使用函数 copy() 阅读全文
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2019年9月16日

摘要:使用在线绘图工具 https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html http://www.biovenn.nl/index.php http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/ 使用 R 语 阅读全文
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摘要:Circos官网 http://circos.ca 在线绘图工具 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/ Circos图的诞生 Circos图诞生于2009年,当时是作为一个绘图工具类的文章发表在Genome Research(最新IF:9.944) 阅读全文
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2019年9月3日

摘要:GEO2R 是GEO数据库官方提供的一个工具,用于进行差异表达分析。 该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中,然后进行差异分析,本质是通过以下两个bioconductor上的R包实现的。 -- GEOquery:用于自动下载GEO数据,并读取到R环境中 -- limma:一个经典的 阅读全文
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2019年8月27日

摘要:网络图(Network)看似复杂,其实构成非常简单,网络图是一种图解模型,形状如同网络,故称网络图,由节点(node)和连线(edge)两个因素组成的。其中 node 又分为 source node(源节点)和 target node(目标节点)两个因素组成的。这里的 node 就是我们的基因,ed 阅读全文
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2019年8月26日

摘要:将fasta文件线性化处理 将fastq文件线性化处理 阅读全文
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2019年8月15日

摘要:R包的安装 1)使用 Rstudio 手动安装 Rstudio的窗口默认为四个,在右下角的窗口的 packages 下会显示所有安装的 R 包 点击 Install -> 输入R 包名 -> 点击 Install 2)使用命令安装 install.packages("R包名") R包的卸载 remo 阅读全文
posted @ 2019-08-15 23:21 0820LL 阅读(1344) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:http://master.bioconductor.org/packages/3.9/bioc/html/Glimma.html 安装 阅读全文
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2019年8月14日

摘要:E-value: The E-value provides information about the likelihood that a given sequence match is purely by chance. The lower the E-value, the less likely 阅读全文
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2019年8月11日

摘要:Surrogate Variable Analysis http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/sva.html 阅读全文
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2019年7月31日

摘要:https://www.jianshu.com/p/4519d2e64a49 阅读全文
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摘要:https://www.jianshu.com/p/a3ac3568adde 阅读全文
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摘要:1. DNA测序技术 https://www.jianshu.com/p/6122cecec54a 2.FASTA和FASTQ文件格式 https://www.jianshu.com/p/50ff302d049f 3.数据质控 https://www.jianshu.com/p/36891a89ed 阅读全文
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2019年7月29日

摘要:下载地址:http://sangerbox.com/ https://shengxin.ren/article/208 Understanding TCGA mRNA Level3 analysis results files from FireBrowse http://zyxue.github. 阅读全文
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2019年7月28日

摘要:order() 的返回值是对应“排名”元素所在向量中的位置。注意返回的不是元素本身,而是元素的位置。 sort() 是直接对向量中的元素进行排序,返回的是排序后的元素组成的向量。 rank() 是求秩的函数,返回值是这个向量中对应元素的排名。 > x<-c(1,5,8,2,9,7,4)> order 阅读全文
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2019年7月27日

摘要:bioconduction 主页 http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html 安装 有时可能因为镜像或者网络的原因导致安装失败 我在 RStudio 使用 清华的镜像 在线文档 阅读全文
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摘要:Error in readRDS(dest) : error reading from connection 解决办法:可能是镜像设置错误,导致无法抓取文件 修改 RStudio 中的镜像地址 阅读全文
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2019年7月23日

摘要:这几个都是R语言中的特殊值,都是R的保留字, NA:Not available 表示缺失值 用 is.na() 来判断是否为缺失值 NULL:表示空值,即没有内容 用 is.null() 来判断是否为空值 NaN:Not a Number,表示非数值 用 is.nan() 来判断是否为非数值 Inf 阅读全文
posted @ 2019-07-23 15:06 0820LL 阅读(800) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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