GEO2R

GEO2R 是GEO数据库官方提供的一个工具,用于进行差异表达分析。

该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中,然后进行差异分析,本质是通过以下两个bioconductor上的R包实现的。

-- GEOquery:用于自动下载GEO数据,并读取到R环境中

-- limma:一个经典的差异分析软件包,用于执行差异分析

 

GEO2R 用法参考 :

https://www.jianshu.com/p/4a97dbdfc40b

 

posted on 2019-09-03 17:29  0820LL  阅读(286)  评论(0编辑  收藏  举报

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