摘要： ### 1. 脚本主要内容 * 批量读取下机数据 * 计算双细胞比例 * BBKNN去除批次效应 * 去除细胞周期的影响 * 转换为seurat对象 ### 2. 脚本 点击查看代码 ``` import scanpy as sc import anndata as an import pandas 阅读全文

摘要： 点击查看代码 ``` #!/bin/bash #SBATCH -p Batch2 #SBATCH -N 1 #SBATCH -n 1 #SBATCH -c 1 #SBATCH --job-name=jupyter #SBATCH --output=jupy.out #SBATCH --error=j 阅读全文

摘要： 点击查看代码 ``` object.markers 0.15) #所有差异基因 #View(sig_dge.all) library(dplyr) object.markers % filter(p_val_adj % mutate(Difference = pct.1 - pct.2) libra 阅读全文

摘要： 点击查看代码 ``` import argparse import scanpy as sc import hotspot import numpy as np import mplscience import matplotlib import matplotlib.pyplot as plt i 阅读全文

摘要： 1. 多线程返回值的获取 点击查看代码 ``` import argparse import os from pickle import FALSE import threading import shutil import datetime import json import time impo 阅读全文

摘要： 点击查看代码 ``` tryCatch(libray(xx),warning = function(w){print("出现警告")}, error=function(e){print("出现错误")}, finally={ print("导入ggplot2包") library(ggplot2) 阅读全文

摘要： pdf("test.pdf", onefile = FALSE,width = 8,height = 5) p6 dev.off() 阅读全文

摘要： 点击查看代码 ``` as.data.frame(t(sapply(msigdbr_list, "[", i = 1:max(sapply(msigdbr_list, length))))) ``` 阅读全文

摘要：  阅读全文

摘要： 每次加载R包让人很烦 可以cd到R/etc/ ,vim Rprofile.site，并写入 点击查看代码 .First <- function(){ library(data.table) library(Seurat) library(dplyr) library(ggplot2) library 阅读全文