摘要： 图片参考：郭老师的nc 点击查看代码 library(Matrix) library(Matrix.utils) library(plyr) library(dplyr) library(Seurat) library(sctransform) library(igraph) library(fac 阅读全文

摘要： 点击查看代码 #!~/soft/miniconda3/envs/py3/bin/Rscript #加载R包 suppressPackageStartupMessages(library(data.table)) suppressPackageStartupMessages(library(rtrac 阅读全文

摘要： 点击查看代码 #!~/soft/miniconda3/envs/py3/bin/Rscript 需要修改 ############## 非模式生物 go kegg 富集分析 ######################## ## 1. 参考链接：https://zhuanlan.zhihu.com/ 阅读全文

摘要： 由于没有管理权限，但工作又需要在计算节点配置一些基本的软件。终于只能通过scp将管理节点的conda环境整个打包到计算节点中。中间还是遇到一些麻烦的，但总算是解决了。 一 迁移anaconda 点击查看代码 scp -r 路径/miniconda3 用户@ip:要迁入得路径 二 修改配置文件 点击查 阅读全文

摘要： 实验室的集群不知道是怎么回事，设置镜像总让人头疼，简单记录下可以用的镜像。 点击查看代码 channels: - defaults show_channel_urls: true default_channels: - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anac 阅读全文

摘要： 1. 报错内容： 点击查看代码 > ah <- AnnotationHub() Cannot connect to AnnotationHub server, using 'localHub=TRUE' instead Error in .updateHubDB(hub_bfc, .class, u 阅读全文

摘要： ###一点感悟 前两天师兄让我安装Scissor(作用：寻找与某一性状显著相关的单细胞亚群，然后从表型的角度解释这些细胞亚群的生物学意义)。但是实验室的集群总是报错，终于还是解决了。 ####报错内容： ####解决办法： 点击查看代码 #下载好github上的R包，再unzip 解压缩； #通过本 阅读全文

摘要： 实验室集群配置 实验室服务器是十多年前组装的，CentOS release 6.9，总共8个计算节点和一个fat01节点，含两块硬盘，存储大小分别为9T和35T。总体来说，还是满足日常的计算任务的。但是由于一些库文件实在是太旧了，所以还是谷歌了好久。简单的记录一下吧，方便之后整理。 ###具体过程 阅读全文