摘要：
乳腺癌亚型（Breast Cancer Subtype） 是指根据乳腺癌的分子特征、病理特征或临床表现，将乳腺癌患者划分为不同类别的分类方法。不同亚型的乳腺癌在生物学行为（如生长速度、侵袭性）、治疗反应和预后（生存率）上存在显著差异。分型的目的是为患者提供更精准的诊断、预后评估和个体化治疗方案。 1 阅读全文
posted @ 2025-03-28 22:03
殷素
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摘要：
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304225000789?via%3Dihub 1.研究背景和理论基础 现有分类方法的局限性 当前乳腺癌分类（如PAM50亚型）依赖少数标记基因或蛋白的表达，无法充分捕捉样本间共同的生物学特 阅读全文
posted @ 2025-03-28 21:45
殷素
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摘要：
1. TCGA 背景 TCGA （The Cancer Genome Atlas，癌症基因组图谱）是美国国家癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所（NHGRI）联合发起的大型癌症研究计划（2006-2018）。其目标是通过高通量组学技术（如基因组、转录组、表观组等），系统解析癌症的分子特征，为精 阅读全文
posted @ 2025-03-28 20:51
殷素
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摘要：
1.基本概念 T检验 是一种统计学方法，用于判断两组数据的均值是否存在显著差异 。其核心思想是通过计算“t值”和对应的“p值”，评估观察到的差异是否由随机误差引起，还是反映了真实的生物学或实验效应。 适用场景 ： 比较两组独立样本的均值（如对照组 vs 实验组）。 检验单组数据的均值是否与已知理论值 阅读全文
posted @ 2025-03-28 19:57
殷素
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摘要：
1.基本概念 WGCNA 是一种基于基因表达数据的系统生物学方法，通过构建基因共表达网络，识别高度协同表达的基因模块（Module，并探索这些模块与表型（如疾病、生理特征）之间的关联。其核心思想是：“共表达的基因可能在功能上相关” 。 基因共表达网络 ：以基因表达数据为基础，计算基因间的表达相关性（ 阅读全文
posted @ 2025-03-28 16:54
殷素
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1.KEGG的基本概念 KEGG是一个整合基因、通路、疾病和药物信息的综合数据库，旨在系统地解析基因与基因组的功能。其核心内容是KEGG通路（Pathway） ，通过手工绘制的分子相互作用网络图（如代谢通路、信号转导通路等），将基因、蛋白质、化合物的功能联系起来。 KEGG通路分为以下几类： 代谢通 阅读全文
posted @ 2025-03-28 16:38
殷素
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1.基本概念 基因本体论（Gene Ontology，GO） 是一个国际标准化的基因功能分类系统，旨在统一描述基因或蛋白质在生物体中的功能。它通过三个独立的本体（Ontology）对基因功能进行分类： 生物过程（Biological Process, BP） ：描述基因参与的生物学活动，例如“细胞分 阅读全文
posted @ 2025-03-28 16:30
殷素
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在B站刷到的超赞的机器学习算法概述视频 https://www.bilibili.com/video/BV1ZHq6Y6Ewm/?spm_id_from=333.1387.list.card_archive.click&vd_source=7886c1032c713934d001c2b46a0c0f 阅读全文
posted @ 2025-03-28 15:00
殷素
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摘要：
在B站看到讲解这三种数据降维方法的最好的视频 https://www.bilibili.com/video/BV1dpStYvEh8/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=7886c1032c713934d001c2b46a0c0f 阅读全文
posted @ 2025-03-28 14:20
殷素
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010482523011290?ref=pdf_download&fr=RR-2&rr=92739409ac57099f 1. Abstract 肿瘤转移是导致肿瘤进展和治疗困难的主要原因之一。基 阅读全文
posted @ 2025-03-28 11:45
殷素
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摘要：
免疫浸润分析 （Immune Infiltration Analysis）是一种用于研究肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）中免疫细胞组成和功能的生物信息学方法。它主要用来评估肿瘤组织中不同类型的免疫细胞的比例、分布和活性，从而揭示免疫系统在肿瘤发生、发展、治疗反应以 阅读全文
posted @ 2025-03-28 10:27
殷素
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