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摘要： Win11默认就是降频，不降频的性能模式只能手动开启。 powercfg -duplicatescheme e9a42b02-d5df-448d-aa00-03f14749eb61 powercfg -setactive 6002cd0d-45bc-4a54-b13a-dd0286d509dd 阅读全文

摘要： 如果是都在编码区，那么肯定是严格的翻译关系。 对于DNA我们需要确定阅读框在哪，可能是0,1,2。 DNA是有反链的，也有可能是反链的0,1,2，也有可能对应上。 最后比较重合部分，也就是最长公共子串。 def get_reverse_complement(dna_sequence): """ 获取 阅读全文

摘要： 在Windows上安装Git。 打开GitBash 输入 ssh-keygen 生成密钥，回车确定。 在用户目录 mkdir .ssh 并赋予权限 chmod 700 -R .ssh 在.ssh文件夹中，创建文件 touch authorized_keys 并赋予权限chmod 600 author 阅读全文

摘要： 研究背景 基因组DNA序列是生命的蓝图，指导着细胞复杂性的发展。虽然蛋白质编码区直接编码生物化学功能，但真核生物基因组的大部分由非编码序列组成。这些非编码区域包含各种调控元件（如启动子、增强子），它们像指挥家一样协调基因的开启和关闭。 一个关键的生物学挑战在于，基因组在细胞核内折叠成多尺度的三维（3 阅读全文

摘要： 研究背景 随着基因组测序技术的飞速发展，海量的基因组数据以前所未有的速度涌现。然而，要从这些原始的DNA序列中解读出生命的蓝图，精确地识别出基因的位置和结构（即基因注释）是至关重要的一步。传统基因预测方法，如隐马尔可夫模型（HMM），在处理复杂的生物学信号时能力有限，通常需要依赖RNA测序等额外的实 阅读全文

摘要： 引言 近年来，以GPT-4为代表的基础模型（Foundation Models），或称大语言模型（LLMs），通过在海量文本数据上进行自监督预训练，学会了理解和生成人类语言的强大能力，并彻底改变了自然语言处理领域。这一成功范式迅速启发了其他科学领域的研究者。如果将DNA序列——这段由A, T, C, 阅读全文

摘要： conda activate evo2 cd ~/evo2_contrast_enhanced/notebooks/clinvar/utils CUDA_VISIBLE_DEVICES=1,2 python evo2run.py 根据需要修改 或者是nohup conda activate evo2 阅读全文

摘要： 简单而言就是 pos要少一位数 pos=row["pos"]-1 seq = genome[chrom][pos] from pyensembl import EnsemblRelease from pyfaidx import Fasta ensembl = EnsemblRelease(110) 阅读全文

摘要： 版本选择 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe 直接选择最新版本即可。 自动配置环境变量 一点要选择Just me才能自动配置环境变量！！ 重装前要删除 阅读全文

摘要： 核心记忆口诀：“正常叙述用正体，特殊对象用斜体，标题重点可加粗” 一、什么时候用 正体 ？ 正体就是默认字体，是论文的“正文”。 简单说：除了下面提到的“特殊情况”，其他所有文字都用正体。 必须用正体的常见情况： 论文的绝大部分文字：摘要、引言、章节正文、结论、致谢等。 单位符号：kg（千克）、s（ 阅读全文