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ylifs
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2026年1月8日
国产ARM服务器使用排雷
摘要: 这类吃补贴的属于非商业,特别难用,一定要找文档。 根据文档,成功激活使用pytorch #!/bin/bash nvidia-smi module load miniforge3/24.1 source activate py310-torch240 python gpu.py sh train_c
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posted @ 2026-01-08 21:11 ylifs
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2025年12月31日
非编码变异一般不会影响转录的蛋白质的结果,那这种情况下它是怎么构成致病的呢
摘要: 传统的遗传学研究大多集中在外显子(编码蛋白质的区域),因为那里的变异会直接改变蛋白质的“图纸”。 然而,人体基因组中只有约 1.5% 是编码区的,剩下的 98.5% 曾被认为是“垃圾 DNA”。现在我们知道,这些非编码区就像是细胞内的“精密控制系统”。即使蛋白质的“图纸”(序列)没变,但如果“施工时
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posted @ 2025-12-31 00:16 ylifs
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2025年12月28日
Z分布转换
摘要: ## 分布转换!! import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns from scipy.stats import norm import os def Dist
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posted @ 2025-12-28 20:29 ylifs
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2025年12月23日
Pandas重置索引
摘要: 一般而言,直接用iloc截取出来的seriers是用指针指向了原来的索引。 不能用0来索引。 可以先复制,再reset_index(drop=True,inplace=True)重置索引
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posted @ 2025-12-23 00:09 ylifs
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2025年12月19日
Vscode连接服务器失败
摘要: 如果排除网络问题,那么这种问题就是vscode的服务端有问题,解决思路是删除服务端重装。 尝试删除文件夹 rm -r ~/.vscode-server 如果删除失败,那么就是有占用,把占用信息给LLM生成kill指令,结束掉进程再删。 这时候重新连接就行了。 为了防止服务端和客户端的不匹配问题,建议
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posted @ 2025-12-19 14:31 ylifs
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2025年12月17日
Win11坑人的电源模式
摘要: Win11默认就是降频,不降频的性能模式只能手动开启。 powercfg -duplicatescheme e9a42b02-d5df-448d-aa00-03f14749eb61 powercfg -setactive 6002cd0d-45bc-4a54-b13a-dd0286d509dd
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posted @ 2025-12-17 21:02 ylifs
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2025年12月16日
关于DNA和蛋白质的对应
摘要: 如果是都在编码区,那么肯定是严格的翻译关系。 对于DNA我们需要确定阅读框在哪,可能是0,1,2。 DNA是有反链的,也有可能是反链的0,1,2,也有可能对应上。 最后比较重合部分,也就是最长公共子串。 def get_reverse_complement(dna_sequence): """ 获取
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posted @ 2025-12-16 21:43 ylifs
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ssh免密连接服务器配置
摘要: 在Windows上安装Git。 打开GitBash 输入 ssh-keygen 生成密钥,回车确定。 在用户目录 mkdir .ssh 并赋予权限 chmod 700 -R .ssh 在.ssh文件夹中,创建文件 touch authorized_keys 并赋予权限chmod 600 author
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posted @ 2025-12-16 14:46 ylifs
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2025年12月2日
Nat Commun | DNALONGBENCH:基因组学长距离DNA预测任务的综合基准测试套件
摘要: 研究背景 基因组DNA序列是生命的蓝图,指导着细胞复杂性的发展。虽然蛋白质编码区直接编码生物化学功能,但真核生物基因组的大部分由非编码序列组成。这些非编码区域包含各种调控元件(如启动子、增强子),它们像指挥家一样协调基因的开启和关闭。 一个关键的生物学挑战在于,基因组在细胞核内折叠成多尺度的三维(3
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posted @ 2025-12-02 20:15 ylifs
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Nat Methods | Helixer:结合深度学习与隐马尔可夫模型的真核生物基因从头预测工具-获取蛋白质序列
摘要: 研究背景 随着基因组测序技术的飞速发展,海量的基因组数据以前所未有的速度涌现。然而,要从这些原始的DNA序列中解读出生命的蓝图,精确地识别出基因的位置和结构(即基因注释)是至关重要的一步。传统基因预测方法,如隐马尔可夫模型(HMM),在处理复杂的生物学信号时能力有限,通常需要依赖RNA测序等额外的实
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posted @ 2025-12-02 20:02 ylifs
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