荧光滤光片（Fluorescence Filters））指的是应用于荧光系统的各种滤光片，包括提取荧光能量或获得荧光成像。它的主要特点是对干扰光的隔离度好，自发荧光干扰少。象PCR仪，荧光免疫分析仪，荧光显微镜等各种医疗分析和检测仪器中都会用到荧光滤光片。通常要求荧光滤光片的截止深度在OD5（optical density，光密度，OD=－lgT）以上。
图1.荧光滤光片
荧光滤光片一般包含三片组合，即激发滤光片、发射滤光片和二色镜。 有的系统不带二色镜，这是由光路结构决定的。也有的系统用激光进行激发，不需要激发滤光片。
激发滤光片（Exciting Filter, Exciter Filter,Excitation Filter )：在荧光显微镜中，只有激发荧光的波长可通过的滤光片。过去使用的是短波通滤光片，现在基本上都使用带通滤光片。其外壳上刻有箭头，指示所推荐的光的传播方向。
发射滤光片（Emitting Filter,Emission Filter ,Barrier Filter，Emitter)：选择并传输样本发出的荧光，其他范围光线截止。发射光的波长比激发光的波长要长（更加靠近红色）。可以选择带通滤光片或者长波通滤光片作为发射滤光片。其外壳上刻有箭头，指示所推荐的光的传播方向。
二色镜（Dichroic Mirror,Dichroic Beamsplitter,Dichromatic Beamsplitter）：又称二向色滤光片或分色镜。与显微镜的光路呈45°角放置。这片滤光片反射一种颜色光（激发光）并且透射另一种颜色光（发射光），激发光的反射率大于90%，发射光的透射率大于90%。光谱中不能透过的部分被反射而不是被吸收。滤光片在透射光和反射光下的颜色互为补色，因而又称二向色滤光片。
图2.荧光滤光片工作示意图
图3.荧光滤光片曲线示意图
对于荧光成像系统中，二色镜和发射滤光片的透过面形有一定要求，如果忽略这个要求，有可能所成的荧光图像是模糊的。
