摘要：
1.python安装 我的电脑是32位的，安装了Python 3.5.4版本其它安装版本 2.python环境变量配置 将”C:\Program Files\Python35",”C:\Program Files\Python35\Scripts”(视具体python安装路径添加)添加进环境变量pa 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:52
青蛙快飞
阅读(700)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
vcf格式示例 ##fileformat=VCFv4.1 ##FILTER=<ID=LowQual,Description=”Low quality”> ##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description=”Allelic depths for the 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:52
青蛙快飞
阅读(3446)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
primer3是由怀特黑德生物医学研究所Steve Rozen等人发起的一个自动寡核苷酸分析和设计的开源项目，被广泛应用在分子生物领域。primer3-py是用python语言封装的primer3的API，官方推荐安装linux，mac平台，如何在windows平台下安装呢？ 阅读primer3-p 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:51
青蛙快飞
阅读(1619)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
pysam模块 因为要分析sam文件中序列的情况，因此要对reads进行细分，所以之前想用数据库将sam文件信息存储，然后用sql语句进行分类。后来发现很麻烦，pysam就是一个高效读取存储在SAM / BAM / CRAM格式文件中的映射短读序列数据信息的python模块，可以轻松地对reads进 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:47
青蛙快飞
阅读(2885)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
简介 SRA数据库是美国国立卫生研究院（NIH）的高通量测序数据的主要归档，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，其中包括NCBI序列读取存档（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数据库 日本（DDBJ）。 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的。 SRA数据库数据来自高 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:44
青蛙快飞
阅读(3080)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
一、BED 文件格式 BED 文件格式提供了一种灵活的方式来定义的数据行，以用来描述注释的信息。BED行有3个必须的列和9个额外可选的列。 每行的数据格式要求一致。 必须包含的3列： 1.chrom, 染色体名字(e.g. chr3， chrY) 2.chromStart, 目标区段在染色体起始位置 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:43
青蛙快飞
阅读(1230)
评论(0)
推荐(0)
摘要：
UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的，该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息，并提供一系列的网页分析工具。 1.MySQL安装 本人使用的是Centos6.8系统，推荐使用y 阅读全文
posted @ 2018-07-18 20:41
青蛙快飞
阅读(432)
评论(0)
推荐(0)
浙公网安备 33010602011771号