生信小栈

摘要： 1. 安装包 install.packages("BiocInstaller") 2. 卸载已安装包 remove.packages("BiocInstaller") 3. 查看已加载包 (.packages()) 4. 卸除已加载包 detach("package:BiocInstaller") 阅读全文

摘要： MySQL 是最流行的关系型数据库管理系统，在WEB应用方面 MySQL 是最好的RDBMS(Relational Database Management System：关系数据库管理系统)应用软件之一。 常用的生物数据库Ensembl和UCSC数据存储的均使用MySQL进行存储的。MySQL在wi 阅读全文

摘要： 之前使用的是windows7 + ubuntu18.04双系统，硬盘分区采用的是GPT格式。重装windows系统时，提示“windows无法安装到这个磁盘。选中的磁盘采用GPT分区形式”，导致安装失败，下面就来讲解一下如何解决。 1. 在系统提示无法安装的那一步，按住“shift+f10”，呼出“ 阅读全文

摘要： 在本章中，我将概述Python正则表达式和Python运算符。我们还将研究标准的基本分子生物学技术的编程：发现序列的限制性图谱。限制性消化是“指纹”DNA的原始方法之一；现在可以在计算机上模拟这个。 限制性图及其相关的限制性位点是实验室中的常见计算，由几个软件包提供。它们是克隆实验的重要工具；例如， 阅读全文

摘要： 1. gcc源码下载 ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/releases/ 下载你所需要的GCC版本。 2. 下载gcc依赖库源码 gmp ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/infrastructure/gmp-6.1.0.tar.bz2 mpc ftp://gc 阅读全文

摘要： 1、通过C语言编写一个简单max函数，生成一个max.so链接库 2、使用Python语言调用libmax.so链接库中的max函数 阅读全文

摘要： Gene Expression Omnibus（GEO）是一个公共存储库，可以存档和自由分发由科学界提交的全套微阵列，新一代测序和其他形式的高通量功能基因组数据。 除数据存储外，还提供一系列基于Web的界面和应用程序，以帮助用户查询和下载存储在GEO中的研究和基因表达模式。 GEO的数据储存方式 G 阅读全文

摘要： Gnuplot是一个用C编写的用于生成二维和三维图命令行程序，对于脚本驱动的图形，gnuplot是迄今为止最受欢迎的程序。在Centos安装gnuplot，如下所示： 在运行一些生物信息软件的时候，提示：Could not find/open font when opening font “aria 阅读全文

摘要： 在生信处理流程中，从最初的fastq文件，经过分析处理后，会生成一堆的后续文件，如何在流程中合理的命名呢？ 通常在批处理模式中，我们会得到多个样本*.fastq（或*.fq、*.fastq.gz、*.fq.gz）路径名文件sample.txt。如下所示： 上述，是一个多个双端*.fastq全路径文件 阅读全文

摘要： useradd具体参数 useradd创建的账户的默认值 1）新用户添加到GID为100的公共组 2）新用户的HOME目录将会位于/home/username 3）新用户账户密码在过期后不会被禁用 4）新用户账户未被设置为某个日期后就过期 5）新用户账户将bash shell作为默认shell 6） 阅读全文