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文章转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/5a5-6pXHfvyDc2Kfp4xDeQ 文件格式解释 PDB文件 (详细格式描述) 基本信息部分 HEADER记录: 包括分子的分类、提交日期、PDB ID TITLE记录: 为该结构的描述，如果有多行，除第一行外，其它行有连续 阅读全文
posted @ 2017-07-29 17:25
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在ubuntu中添加新硬盘 转载于 http://www.cnblogs.com/unipower/archive/2009/03/08/1406230.html 前言 安装新硬盘这种事情并不会经常,发生同样它也并不复杂.本文将向你说明如何在现有的Ubuntu系统下安装一个新硬盘,并为它设置好分区然 阅读全文
posted @ 2017-07-25 18:01
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http://blog.sciencenet.cn/blog-2985160-950873.html 利用R/Bioconductor分析结肠癌细胞系差异表达基因 已有 1230 次阅读 2016-1-17 02:35 |个人分类:R/Bioconductor|系统分类:科研笔记|关键词:结肠癌 细 阅读全文
posted @ 2017-07-24 02:12
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文章转载于 Original 2017-06-12 liuhui 生信百科 相似的基因在不同物种中，其功能往往保守的。显然，需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能，否则，不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同，将极大限制学术的交流。而 Gene Ontology (GO) 阅读全文
posted @ 2017-07-16 16:02
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转载于 Original 2017-06-20 liuhui 生信百科 KEGG 数据库中，把功能相似的蛋白质归为同一组，然后标上 KO 号。通过相似性比对，可以为未知功能的蛋白序列注释上 KO 号。通过KEGG数据库的注释极大的方便我们进行生物学通路的研究，可以直接查看物种某条生物学通路上基因的存 阅读全文
posted @ 2017-07-16 15:15
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文章转载于 Original 2017-06-08 Jolvii 生信百科 由于生物信息的大部分工作都是在没有 root 权限的集群上进行的，本期我主要介绍一下非 root 用户怎么安装常用的软件。工欲善其事，必先利其器！ 准备工作 1 首先我们建一个文件夹，用来存储我们自己编译的程序 ($HOME 阅读全文
posted @ 2017-07-15 22:31
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文章转载于 Original 2017-07-06 Jolvii 生信百科 介绍一下如何理解 FastQC 各模块的结果 FastQC 的使用 FastQC的安装介绍请看这里。FastQC 支持 fastq、gzip 压缩的 fastq、SAM、BAM 等格式，在不指定文件类型的情况下，FastQC 阅读全文
posted @ 2017-07-15 22:05
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文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对（或多序列联配，multiple sequence alignment，MSA），是指把多条（3 条或以上）有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对，尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一列上。这样做的意义是，对 阅读全文
posted @ 2017-07-15 21:43
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文章转载于 Original 2017-07-08 Berlin 生信百科 （1）距离法 对于UPGMA树现在已经很少见了，我只有在处理SSR数据的时候分析过一次，ME的方法不适用于物种数目较多的时候，计算时间较长。因此在这里以邻接法，NJ（Neighbor-Joining）为代表进行介绍， 邻接法 阅读全文
posted @ 2017-07-15 20:48
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文章转载于 Original 2017-07-08 Berlin 生信百科 达尔文在19世纪中叶创立了科学的生物进化学说——达尔文进化论。以自然选择为主要核心，他第一次对整个生物界中的发生和发展做出了唯物的、规律性的一个解释，从而推翻了特创论等唯心主义的形而上学在生物学当中的统治地位，使得进化生物学 阅读全文
posted @ 2017-07-15 20:32
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