2017年7月29日
分子对接技术
摘要： 转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/asAJDttAvsCLGd3PPU2agQ 分子对接(Molecular Docking)理论 所谓分子对接就是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量匹配相互识别找到最佳匹配模式的过程。分子对接对酶学研究和药物设计中有重要的应用意义。 分 阅读全文
posted @ 2017-07-29 17:45 xiaojikuaipao 阅读(3441) 评论(0) 推荐(1)
Docking非原生配体
摘要： 转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/VDN1qAZGIMol6prwQW4umw Docking非原生配体 在前面的例子中，AutoDock Vina能把配体构象调整到几乎原生的构象，验证了这一预测方法的准确度。下面，我们尝试docking另外一个配体药物nelfinavi 阅读全文
posted @ 2017-07-29 17:41 xiaojikuaipao 阅读(1060) 评论(0) 推荐(0)
用PyMOL展示配体和受体相互作用的原子和氢键
摘要： 转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/P62sjqhSTxmWVicrEAk-RQ 为了简化展示过程，我们设计了一个pml脚本 (脚本内有很详细的解释)，只需要修改脚本里面受体和配体的名字，然后在PyMOL的命令行界面输入PyMOL> run display.pml即可获得展 阅读全文
posted @ 2017-07-29 17:34 xiaojikuaipao 阅读(5951) 评论(0) 推荐(0)
分子对接基础知识
摘要： 文章转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/5a5-6pXHfvyDc2Kfp4xDeQ 文件格式解释 PDB文件 (详细格式描述) 基本信息部分 HEADER记录: 包括分子的分类、提交日期、PDB ID TITLE记录: 为该结构的描述，如果有多行，除第一行外，其它行有连续 阅读全文
posted @ 2017-07-29 17:25 xiaojikuaipao 阅读(3858) 评论(0) 推荐(0)