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文章转载于 Original 2017-06-08 Jolvii 生信百科 由于生物信息的大部分工作都是在没有 root 权限的集群上进行的,本期我主要介绍一下非 root 用户怎么安装常用的软件。工欲善其事,必先利其器! 准备工作 1 首先我们建一个文件夹,用来存储我们自己编译的程序 ($HOME 阅读全文
posted @ 2017-07-15 22:31
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文章转载于 Original 2017-07-06 Jolvii 生信百科 介绍一下如何理解 FastQC 各模块的结果 FastQC 的使用 FastQC的安装介绍请看这里。FastQC 支持 fastq、gzip 压缩的 fastq、SAM、BAM 等格式,在不指定文件类型的情况下,FastQC 阅读全文
posted @ 2017-07-15 22:05
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文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对(或多序列联配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多条(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对,尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一列上。这样做的意义是,对 阅读全文
posted @ 2017-07-15 21:43
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文章转载于 Original 2017-07-08 Berlin 生信百科 (1)距离法 对于UPGMA树现在已经很少见了,我只有在处理SSR数据的时候分析过一次,ME的方法不适用于物种数目较多的时候,计算时间较长。因此在这里以邻接法,NJ(Neighbor-Joining)为代表进行介绍, 邻接法 阅读全文
posted @ 2017-07-15 20:48
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文章转载于 Original 2017-07-08 Berlin 生信百科 达尔文在19世纪中叶创立了科学的生物进化学说——达尔文进化论。以自然选择为主要核心,他第一次对整个生物界中的发生和发展做出了唯物的、规律性的一个解释,从而推翻了特创论等唯心主义的形而上学在生物学当中的统治地位,使得进化生物学 阅读全文
posted @ 2017-07-15 20:32
xiaojikuaipao
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