摘要:1. 下载安装包 安装包下载地址是http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/,选择自己合适的版本,我下载1.9.3版本 2. 安装必要库 yum install freeglut* 3. 解压 tar zxvf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA 阅读全文
AMBER: CPPTRAJ Tutorial C0
2019-03-01 11:39 by 丨o聽乄雨o丨, 3058 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:CPPTRAJ作为PTRAJ的继任者,拥有比PTRAJ更强大的功能,本教程会简要的介绍CPPTRAJ的用法及注意事项。 需要的文件: trpzip2.gb.nc trpzip2.ff10.mbondi.parm7 Loading a Topology and Trajectory 使用cpptraj 阅读全文
解决centos7.x图形化界面卡死(鼠标能动,但不能点击)问题
2019-02-19 17:22 by 丨o聽乄雨o丨, 13514 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:有时会由于某些原因(CPU过热?Mem占用过高?)导致centos7.x图形界面卡死,下面是解决办法,此方法不会关闭你打开的terminal。 1. 首先top命令查看gnome-shell的PID 2. 然后使用kill关闭进程: 3. 最后,系统会自动重启gnome-shell 问题解决! 阅读全文
linux 返回上次历史目录
2019-02-18 09:11 by 丨o聽乄雨o丨, 1878 阅读, 1 推荐, 收藏,
摘要:我们使用linux的转换目录命令 cd 时经常会遇到想回到cd之前目录的情况,比如不小心按了 cd 回车,跳出了工作目录,又想回到刚刚的目录。 这种情况下,就用到了我们这篇博客的主角 cd - 。 cd - 命令可以回到上一个目录,等同于 cd $OLDPWD 执行此命令后,目录会变到上次目录,并返 阅读全文
linux中巧用ctrl-z后台运行程序
2019-02-02 19:27 by 丨o聽乄雨o丨, 1537 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:我们知道后台运行任务时,可以用 () 和 &,但是有的时候我们会忘记加&,对于执行需要很长时间的任务来说,Ctrl+Z可能是一个比较好的把任务转入后台的方法。 当我们按下Ctrl+Z时, [1]+ Stopped /root/bin/rsync.sh 然后我们可以把程序调度到后台执行:(bg 后面的 阅读全文
Failed to set MokListRT: Invalid Parameter Something as gone seriously wrong: import_mok_state() failed: Invalid Parameter
2018-12-14 14:09 by 丨o聽乄雨o丨, 5051 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:今天yum update升级centos7,重启后发现开不了机,报错如下: Failed to set MokListRT: Invalid ParameterSomething as gone seriously wrong: import_mok_state() failed: Invalid 阅读全文
RAxML安装
2018-12-14 00:32 by 丨o聽乄雨o丨, 4130 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:1.下载解压 $ wget https://codeload.github.com/stamatak/standard-RAxML/zip/master -O standard-RAxML-master.zip $ unzip standard-RAxML-master.zip $ cd stand 阅读全文
centos7.5图形界面与命令行界面转换
2018-11-05 11:04 by 丨o聽乄雨o丨, 1978 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:查看当前状态下的显示模式: 转换为图形界面: 转换为命令行界面: 阅读全文
centos7.5固定局域网ip
2018-09-29 17:47 by 丨o聽乄雨o丨, 1385 阅读, 0 推荐, 收藏,
摘要:有de时候,比如像我们单位,没事干就停一次网,结果ip变了,还得重新看ip,重新配置,很麻烦,所以干脆把自己ip固定,以不变应万变!!! 1.首先查看自己的ip是什么: $ ifconfig eno1: flags=4163<UP,BROADCAST,RUNNING,MULTICAST> mtu 1 阅读全文
enzyme design 整体流程及感想
2018-08-13 23:43 by 丨o聽乄雨o丨, 2181 阅读, 2 推荐, 收藏,
摘要:想起什么来写什么吧。 整体流程(以Ceas2, TPP, G3P为例): 准备蛋白即配体参数文件(pdb文件需要有header,header的顺序符合cst block的顺序,且residue1和residue2的顺序也必须符合cst block); 设置CST文件; 准备protocol和flag 阅读全文
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