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waterrr404
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2025年4月14日
关于RDkit与PDB中小分子的迷思
摘要: 目的:对于既含有蛋白质,也含有非天然残基、小分子、离子的PDB,提取分子SMILES和原子级别的特征 1. 首先,我考虑了直接用Rdkit来处理完整PDB 直接读取pdb生成rdkit.mol对象: mol = Chem.MolFromPDBFile(input_pdb) Chem.SplitMol
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posted @ 2025-04-14 19:45 waterrr。
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