wangshicheng

2019年7月29日

摘要：基因富集分析是分析基因表达信息的一种方法，富集是指将基因按照先验知识，也就是基因组注释信息进行分类。信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路。这些细胞外的分子信号（称为配体，ligand）包括激素、生长因子、细胞因子、神经递质以及其它小分子化合物等。富集性分阅读全文

posted @ 2019-07-29 14:43 wangshicheng 阅读(3616) 评论(0) 推荐(0)

2019年7月28日

Cytoscape软件简介

摘要： • Cytoscape一款开源的网络显示和分析软件。软件的核心部分提供了网络显示、布局、查询等方面的基本功能。 • Cytoscape源自系统生物学，通过Cytoscape，用户可以在可视化的环境下将这些生物网络跟基因表达、基因型等各种分子状态信息整合在一起，还能将这些网络跟功能注释数据库阅读全文

posted @ 2019-07-28 19:44 wangshicheng 阅读(2767) 评论(0) 推荐(0)

note4

摘要：阅读全文

posted @ 2019-07-28 15:53 wangshicheng 阅读(142) 评论(0) 推荐(0)

git pull遇到错误：error: Your local changes to the following files would be overwritten by merge:

摘要：场景：因为有事情需回到学校搞毕设，同事在公司说接口代码有问题，需要修改；我用笔记本把代码同步到笔记本，然后做了一些修改、提交。修改完成。第二天我来到公司（公司里用台式机，不是自己的笔记本），忘了先git pull到本地之后，直接在台式机上的代码进行编写，突然想起忘了pull了，然后想用git p 阅读全文

posted @ 2019-07-28 09:02 wangshicheng 阅读(212) 评论(0) 推荐(0)

2019年7月27日

note3

摘要： http://js.cytoscape.org/#demos http://www.360doc.com/content/18/0413/13/42030643_745302163.shtml https://blog.csdn.net/zhongzhu2002/article/details/46 阅读全文

posted @ 2019-07-27 20:59 wangshicheng 阅读(145) 评论(0) 推荐(0)

note2

摘要：阅读全文

posted @ 2019-07-27 15:06 wangshicheng 阅读(169) 评论(0) 推荐(0)

2019年7月23日

基因id

摘要：每个物种都有一个对应的Taxonomy ID： 9606 :人类 10090 ：小鼠阅读全文

posted @ 2019-07-23 16:09 wangshicheng 阅读(999) 评论(0) 推荐(0)

2019年7月18日

noteone

摘要：阅读全文

posted @ 2019-07-18 18:23 wangshicheng 阅读(275) 评论(0) 推荐(0)

Cytoscape基础教程笔记

摘要：昨天开始学用Cytoscape，其tutorial分为两个部分，基础的和高级的。基础教程又分成了四课：Getting Started、Filters & Editor、Fetching External Data和Expression Analysis。为防忘记，做个摘记。第一课新手上路地址阅读全文

posted @ 2019-07-18 17:37 wangshicheng 阅读(6609) 评论(0) 推荐(0)

2019年7月11日

初识Uniprot API

摘要： Uniprot，全名Universal Protein，其整合了Swissprot、TrEMBL和PRI-PSD三大数据库，是目前使用非常广泛的蛋白质数据库常规物种的蛋白质组学研究一般会使用Uniprot数据库的蛋白序列作为查库序列，因此蛋白组学的结果常以uniprot ID作为识别ID，而且Un 阅读全文

posted @ 2019-07-11 19:54 wangshicheng 阅读(4029) 评论(0) 推荐(1)

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