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眼睛有光,心中有爱。望着小月亮,想着家中饭。
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2023年8月23日
python自动处理邮件并发送邮件
摘要: 背景:需要读取邮件,对提交的申请进行处理,然后回复邮件。非常繁琐,想要利用python实现自动处理。 第一步:通过IMAP协议读取未读邮件ID;解析标题和邮箱地址。第二步:数据处理,标题提取出账号;不符合规范的手动处理;提取标题符合规范的邮件对应邮箱地址。第三步:通过SMTP协议批量发送邮件。 py
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posted @ 2023-08-23 16:49 望着小月亮
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2022年4月19日
【变异检测】CNV分析和应用
摘要: 前言 拷贝数变异(copy number variation ,CNV)是指基因组上某些大片段的拷贝数增加或减少,可分为缺失(deletion)和重复(duplication)两种类型。CNV是一种基因组结构变异,可通过改变基因剂量和转录结构等来调节有机体的可塑性,是个体表型多样性和群体适应性进化的
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posted @ 2022-04-19 11:10 望着小月亮
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2022年4月18日
【变异检测】CNV PAV INV TRANS变异检测
摘要: 前言 SV(大片段结构变异)指在基因组水平上大片段的insertion,deletion,inversion,translocation,duplication等变异。 SV检测分重测序部分和基因组部分,重测序又分二代测序数据和三代测序数据之分。每种分析方法用到的软件是不一样的,但结果可能有重叠部分
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posted @ 2022-04-18 17:22 望着小月亮
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2022年4月8日
【变异检测】SNP INDEL检测
摘要: 重测序SNP和INDEL变异检测主要有3套方案,samtools+bcftools、GATK、assembly-versus-assembly 1.samtools+bcftools方法 samtools和bcftools是我们做生信最常用的软件之一,功能非常的强大。这套软件组合可以单call,也可
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posted @ 2022-04-08 17:23 望着小月亮
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2022年4月7日
【种群历史动态】评估方法SFS(Site/Allele Frequency Spectrum)
摘要: SFS解释原文:joint SFS – The G-cat 参考博客:种群动态历史评估方法之 SFS(Site/Allele Frequency Spectrum) - 简书 (jianshu.com) 基因组数据统计可以总结数据集中等位基因的变异或分布,而无需我们所有样品的整个基因序列。我们可以选
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posted @ 2022-04-07 16:57 望着小月亮
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2022年4月1日
开启新阶段的旅途
摘要: 今天愚人节,给自己开个玩笑,拷问自己,哈哈! 我这几年有什么建树?分享哪些自己生信经验和知识?自己弱点有明显的改善?逻辑能力有没有强化? 闭着眼睛,想着这些问题,发现自己没有成长多少,说有建树但上升1w米高空看,一文不值。仅在自己小圈子里面分享过几次,但数量太少了,分享的内容自己也忘了差不多,自己没
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posted @ 2022-04-01 18:08 望着小月亮
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2021年2月14日
【python3】python中 r'', b'', u'', f'' 的含义
摘要: r/R:非转义的原始字符串 与普通字符相比,其他相对特殊的字符,其中可能包含转义字符,即那些,反斜杠加上对应字母,表示对应的特殊含义的,比如最常见的”\n”表示换行,”\t”表示Tab等。而如果是以r开头,那么说明后面的字符,都是普通的字符了,即如果是“\n”那么表示一个反斜杠字符,一个字母n,而不
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posted @ 2021-02-14 20:17 望着小月亮
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【python3】excel输入输出
摘要: 链接:https://www.cnblogs.com/wanglle/p/11455758.html 一、openpyxl介绍安装 1.为什么要学Excel 存测试数据 有时候有大批量的数据,存到TXT文件里面显然不是最佳的方式,我们可以存到Excel里面去,第一方便我们存数据和做数据,另一方面方便
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posted @ 2021-02-14 18:57 望着小月亮
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【python3】return和yield的区别
摘要: https://blog.csdn.net/weixin_44108880/article/details/88936505
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posted @ 2021-02-14 18:33 望着小月亮
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【python3】spyder中清除变量命令
摘要: 清除变量 在IPython中输入reset命令 清空IPthon中的输入历史记录 在控制台输入clear或快捷键Ctrl + L
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posted @ 2021-02-14 17:43 望着小月亮
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