随笔分类 -  in文件

in文件——group、msd、diff、vacf、rdf、chunk分层算density、输出xyz轨迹文件-带元素类型
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posted @ 2021-12-21 01:13 一棵开花的树sysu 阅读(9) 评论(0) 推荐(0)
in文件——蒙脱石和水盒子合并
摘要：# INITIALIZATION echo screen dimension 3boundary p p patom_style fullunits real # 变量定义 variable filename1 index mergevariable T0 equal 300 #初始温度设定为298 阅读全文
posted @ 2021-06-06 22:39 一棵开花的树sysu 阅读(405) 评论(1) 推荐(0)
linux计算命令——MS导data、node计算命令、周期性设置、定义变量、设置电荷、group分组、shake控制水分子、固定原子为刚性、控制原子结构不变
摘要：1.在lammps中通过car文件导出data文件 (进入工作目录xxx，文件名xxx很严格，文件名和car和mdf的xxx必须要一样。 cd xxx/ msi2lmp.exe xxx -class I -frc clayff -i > out.log ## clayff力场 msi2lmp.exe 阅读全文
posted @ 2019-12-28 23:51 一棵开花的树sysu 阅读(345) 评论(0) 推荐(0)
in文件
摘要：log mmt.log #目前的笔记，正在studying，不一定全对 in文件很好解释的链接：https://www.docin.com/p-680967917.html # 一、初始化（边界条件）；前两行不要写东西，第一行默认，不用改echo screen #如果脚本有错误可以记录下来，可有可无 阅读全文
posted @ 2019-05-07 15:24 一棵开花的树sysu 阅读(1483) 评论(0) 推荐(1)
in文件注意事项及详细解释（转载）
摘要：转载自:https://www.cnblogs.com/sysu/p/10817315.html 和 https://www.cnblogs.com/panscience/p/4953940.html lammps做分子动力学模拟时，需要一个输入文件（input script），也就是in文件，以及 阅读全文
posted @ 2019-05-06 18:13 一棵开花的树sysu 阅读(2944) 评论(0) 推荐(1)
开始进行lammps手册的学习啦，跟着Manual一边翻译一边做吧！（转载）
摘要：转载自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_64813e370100ngsz.html 注明：黄色部分基本上为不懂的部分，红色字体为所做注释 一、各种文件的介绍： 1 in file:建立该文件以便程序的写入 2 log file：写入状态信息（if the switch 阅读全文
posted @ 2019-05-06 00:17 一棵开花的树sysu 阅读(3256) 评论(0) 推荐(0)
学习lammps 对in文件的一个概述性心得（转载）
摘要：转载自：http://muchong.com/html/201411/8149677.html 写在开头：1.尽量列举了大部分（几乎）的命令2.带星号命令非常重要，大家在看mannual中命令的解释的时候可以重点先看带星号的3.非斜命令是运行一个 常用 模拟所必备的4.命令顺序为一个基本的脚本文件命 阅读全文
posted @ 2019-05-06 00:12 一棵开花的树sysu 阅读(3235) 评论(0) 推荐(0)