随笔分类 -  vmd命令

摘要:输出体系的整个带电量:measure sumweights $all weight charge 给PDB文件设置周期边界条件:pbc set {54 54 24 } -all 将此晶胞内原子脱除周期性pbc unwrap 显示晶胞边界pbc box 体系总质量:measure sumweights 阅读全文
posted @ 2019-05-05 22:35 一棵开花的树sysu 阅读(3103) 评论(0) 推荐(0)
摘要:转载自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_b48a7ac30102w6xg.html 自我学习总结: 1、打开VMD main上Extensions中的TkConsole这是VMD的控制命令区域。 2、围绕x轴旋转90:rotat x by 90 (或者rotat x t 阅读全文
posted @ 2019-05-04 21:21 一棵开花的树sysu 阅读(12060) 评论(0) 推荐(0)