摘要: 写在前面 最近在处理百万级别的单细胞数据,由于默认的CPU跑地太慢了,转头去折腾rapid_singlecell,但发现,这包是真难装。于是,我就打算在OmicVerse里用Pytorch重写单细胞预处理的部分函数。如果有现成的就直接调用,例如torchdr就可以进行PCA的GPU加速。 此外,作为 阅读全文
posted @ 2025-06-08 11:48 Starlitnightly 阅读(498) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 单细胞最好的教程(十八): 细胞类型映射到细胞本体论:让你的单细胞注释更专业! 细胞类型映射到细胞本体论:让你的单细胞注释更专业! 作者按 在单细胞数据分析领域,标准化的细胞类型注释对于数据整合和比较研究至关重要。本文将介绍如何使用Cell Ontology(细胞本体论)来规范化你的细胞类型注释,提高研究的可重复性和可比性。本教程首发于单细胞最好的中文教程,未经授权许可,禁止转 阅读全文
posted @ 2025-06-08 11:41 Starlitnightly 阅读(751) 评论(0) 推荐(0)