摘要：
以亚种为基础，一个亚种的丰度Ab(G) = Ab(U) + Ab(M)，其中 G：物种 U：unique数目，一条reads只比对上单一物种称为unique reads，一个物种的所有unique总和为U M：multiple数目，一条reads比对上多个物种成为multiple reads，一个物 阅读全文
posted @ 2022-09-09 14:19
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defaultdict 需要构造类似{k1: {v11, v12, v13, ...}, k2: {v21, v22, v23, ...}, ...}结构的数据时，可以用collections.defaultdict： from collections import defaultdict a = 阅读全文
posted @ 2022-09-07 17:26
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摘要：
ls 目录 -lR| grep ^- | wc -l 符号意义： ls -lR : 以行形式列出每一个文件（夹）（包括子文件） | : 管道，捕获左边命令的输出，作为右边命令的输入（最后输入）;在这个命令里，相当于：wc -l xxxxx(ls -l统计的结果)，这里的|是“回车键”上面的竖线； g 阅读全文
posted @ 2022-07-29 11:25
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摘要：
各种情况： 1.直接pip install cartopy，安装时就报错，“subprocess的错误，可能和pip无关”，无法安装； 2.按官方文档推荐，安装github上的最新版，效果同1。 3.下载whl文件安装。import cartopy时报错，没有cartopy.trace文件； 4.用 阅读全文
posted @ 2022-03-08 20:26
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摘要：
python的basemap包已经被弃用，取而代之的是cartopy。 如果要安装cartopy，DOS命令“pip install cartopy”。如果安装失败，下载whl文件进行安装，步骤与下面的basemap相同，地址Python Extension Packages for Windows 阅读全文
posted @ 2022-03-07 19:51
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摘要：
PPEt是一款将live2d模型展示在桌面上的程序 安装完成后，因为并不自带模型，所以不会显示模型，需要自己导入； 在线导入地址： 黑猫：https://unpkg.com/live2d-widget-model-hijiki@1.0.5/assets/hijiki.model.json萌娘：htt 阅读全文
posted @ 2022-02-19 18:48
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Python GISAID 病例数据下载 介绍 初遇GISAID，要下载里面的数据，可谓是难于登天。 我自制了一份python脚本，运行稳定；效率高；随机休息，不易被检测封号，放在了下面的链接里，用于下载EpiCoV的病例数据。 下载fastaDNA序列文件请进主页看我的另一篇文章python GI 阅读全文
posted @ 2022-02-19 13:35
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python GISAID 网站爬虫：fasta文件下载 关键词： GISAID；下载；fasta数据；DNA序列；脚本；python；自动化。 简介： GISAID是流行病毒共享组织，网址“www.gisaid.org”，服务器位于美国洛杉矶、旧金山等地， 需要教育邮箱注册账号才能访问其数据。它的 阅读全文
posted @ 2022-02-19 00:41
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摘要：
python文件的.pyw 格式是被设计来运行开发完成的纯图形界面程序的，程序默认由pythonw.exe运行。 将文件后缀名从“.py”改为“.pyw”，即可在隐藏DOS窗口的情况下运行GUI程序。 阅读全文
posted @ 2022-02-16 09:14
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GISAID的验证码很烦人吗？ 用下面这段“python代码+字符集”解决它（识别率95%） API: CharOcr的Ocr(filename)，对filename指定的png图片进行识别。 需要字符集文件夹“../charsPrecise”提供识别资源。 字符集文件“charsPrecise”要 阅读全文
posted @ 2021-11-10 12:53
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