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2023年3月8日
Python获取函数输入参数的方法
摘要: 内建函数locals可以获得当前的闭包 变量:变量值 字典。 例如: def a(k): print(locals()) if __name__ == '__main__': a(k=3) 可以通过字典传入具名参数: def a(k): print(locals()) if __name__ ==
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posted @ 2023-03-08 08:38 小鱼圆又圆
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2023年3月1日
Python 图片转PDF
摘要: 直接给接口吧↓ 用到的库: fpdf,PyPDF2 import fpdf def picture2pdf(pic_path, output_path, vertical=False, format='A4'): # 生成只有一页且铺满源图片的PDF pdf = fpdf.FPDF('l' if v
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posted @ 2023-03-01 13:29 小鱼圆又圆
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2023年2月20日
Python脚本:把本地文件实时更新到服务器上
摘要: # 如果没有安装paramiko,用pip install paramiko安装import paramiko, os, timedef update(addr, usr, pasw, fn, target_path): trans = paramiko.Transport((addr, 22))
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posted @ 2023-02-20 08:46 小鱼圆又圆
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2023年2月17日
测序深度和覆盖度的概念
摘要: 深度(depth): 总测序reads数 / 目标区域长度 覆盖度(coverage): 至少有一个碱基覆盖的位置数量 / 目标区域长度
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posted @ 2023-02-17 10:14 小鱼圆又圆
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2023年2月3日
ls基础用法
摘要: ls是最常用的unix命令之一,用于展示目录下的文件 参数及意义 参数名 含义 a 显示隐藏文件 l 成列显示更多信息 v 按数字排序 h 将文件大小用单位表示。如1.2G 示例: ls -lh
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posted @ 2023-02-03 08:53 小鱼圆又圆
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2023年2月2日
Python的the ssl module in Python is not available
摘要: pip安装时警告:the ssl module in Python is not available Python版本为3.11.1。 问题是缺少ssl包(或者是证书方面的问题),把源设置成http再加上信任该网址的参数就行了: # 永久换源pip config set global.index-u
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posted @ 2023-02-02 22:07 小鱼圆又圆
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vim基础用法
摘要: 如何退出 Esc + :q(或者:wq,如果你改了东西要保存的话;:!q不保存,强制退出) 讲个笑话:我用vim三年了,因为我到现在都不知道怎么退出! 删除所有内容 Esc + ggdG 跳转到指定行 Esc + :行号 进入编辑模式 按i或者insert键等 搜索关键字 :/ 或者 # 去除背景色
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posted @ 2023-02-02 16:47 小鱼圆又圆
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linux查看具体cpu信息、内存信息
摘要: 通过两个文件查看: CPU /proc/cpuinfo 内存 /proc/meminfo 例: cat /proc/meminfo
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posted @ 2023-02-02 15:32 小鱼圆又圆
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bowtie2用法
摘要: 单端: bowtie2 -U 文件名 -p 进程数 1>结果保存位置 双端(两个文件): bowtie2 -1 双端文件1 -2 双端文件2 1>结果保存位置 双端(单个文件): bowtie2 --interleave 文件名 -p 进程数 1>结果保存位置 常用参数含义: 参数名 含义 --no
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posted @ 2023-02-02 14:58 小鱼圆又圆
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命令行结束程序的方法
摘要: 中断程序 命令行输入: kill -2 pid(进程id)(等同于ctrl + C) 键盘快捷键:ctrl + C 终止程序 命令行输入: kill -3 pid(等同于ctrl + |,但某些程序可能不支持) #或者 kill -9 pid(终止信号) # 或者 kill pid(同-9) 键盘快
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posted @ 2023-02-02 11:17 小鱼圆又圆
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