笔记:物种丰度计算方法

以亚种为基础,一个亚种的丰度Ab(G) = Ab(U) + Ab(M),其中

G:物种

U:unique数目,一条reads只比对上单一物种称为unique reads,一个物种的所有unique总和为U

M:multiple数目,一条reads比对上多个物种成为multiple reads,一个物种的所有multiple总和为M

Ab(U) = U/L(g); L(g)为相应物种的genome长度;

Ni 表示 multiple reads 比对上的所有物种;

来源:物种丰度计算 - Lyon2014 - 博客园 (cnblogs.com)

posted @ 2022-09-09 14:19  小鱼圆又圆  阅读(1404)  评论(0)    收藏  举报