笔记:物种丰度计算方法
以亚种为基础,一个亚种的丰度Ab(G) = Ab(U) + Ab(M),其中
G:物种
U:unique数目,一条reads只比对上单一物种称为unique reads,一个物种的所有unique总和为U
M:multiple数目,一条reads比对上多个物种成为multiple reads,一个物种的所有multiple总和为M
Ab(U) = U/L(g); L(g)为相应物种的genome长度;
Ni 表示 multiple reads 比对上的所有物种;