风中之铃

摘要： 1、formatdb -i /share/nas1/huangt/project/IsoSeq/BMK170104-E545-03-a/Analysis_T01/MoveRebundant/T01/combined/all_sizes.quivered_hq.fasta -p F -o T -n T 阅读全文

摘要： 转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6721167201018jik.html Change Logs：13/01/12: 增加了一篇文献，外加一些无聊的修改。12/08/20: 修正了一个代码错误；增加了对-rf(Read filters)参数的说明。12/08/1 阅读全文

摘要： 转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6721167201018fyw.html GATK (全称The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute开发的用于二代重测序数据分析的一款软件，里面包含了很多有用的工具。 网址：http: 阅读全文

摘要： le final.snp.list | perl -lane '{$a+=1;print "$a\t$F[0]\t$F[1]\t$F[1]"}' | less >snp_site le final.indel.vcf |grep -v '^#' | less -S|perl -lane '{$a+= 阅读全文

摘要： 1. SAM格式说明 SAM代表Sequence Alignment/Map格式，是一种制表符分隔的文本格式，包含一个可选的头部分（header section，有人称之为“注释部分”），和一个比对部分（alignment section）。如果包含头部分，那么头部分必须置于比对部分之前。头部分的行 阅读全文

摘要： 一、更改文件属性 1、chgrp：更改文件属组 语法： 参数选项 -R：递归更改文件属组，就是在更改某个目录文件的属组时，如果加上-R的参数，那么该目录下的所有文件的属组都会更改。 2、chown：更改文件属主，也可以同时更改文件属组 语法： chown [–R] 属主名 文件名 chown [-R 阅读全文

摘要： 转载http://www.cnblogs.com/itcomputer/p/4888438.html /proc/cpuinfo文件分析 根据以下内容，我们则可以很方便的知道当前系统关于CPU、CPU的核数、CPU是否启用超线程等信息。 <1>查询系统CPU的个数：cat /proc/cpuinfo 阅读全文

摘要： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide ###TSA提交流程 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/ ### 阅读全文

摘要： 1、ncbi登陆，进入SRA,进入new submission 2、 1）SUBMITTER 2）PROJECT TYPE Raw sequence reads 和 ranscriptome or Gene expression monoisolate(单样本) multiisolate（同一个物种 阅读全文

摘要： 1、批量建立文件 1) touch A{1..10} 或 touch linux-`seq 10` 2) for i in {1..10};do echo $i; touch $PWD/; done 3) 2) for i in `seq 10`;do echo $i; touch $PWD/; d 阅读全文