风中之铃

摘要： 参考：http://www.cnblogs.com/qianmojing/p/6484162.htmlhttp://www.jb51.net/article/70729.htmhttp://www.cnblogs.com/jhj117/p/4944790.htmlhttps://www.zhihu. 阅读全文

摘要： 转载：http://www.oebiotech.com/Article/mirnabjyyc.html http://www.ebiotrade.com/newsf/2014-9/201492594150379.htm miRNA自从被发现以来，一直备受关注，俨然已成为非编码RNA家庭中永不凋零的“ 阅读全文

摘要： 转载：http://www.bio1000.com/experiment/fenzi/237846.html 标签： NCBI Blast LASTP 摘要 : NCBI BLAST比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程，常用在线的BLAST比对工具进行序列比对分析和引物设计 阅读全文

摘要： 1、Prepare necessary input files（可以参考上次的博客http://www.cnblogs.com/renping/p/7391028.html） 1）对fq1和fq2合并 cat fq1 fq2 2）对bam 文件转换成psl格式 /share/nas2/genome/ 阅读全文

摘要： 转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_c5a35e780102wtxl.html 生物信息很多软件都是用java写的，所以需要在linux上配置java运行环境。平台上的java 是1.7x的版本，但是一些生物信息软件（比如picard，trimmomatic,GATK 阅读全文

摘要： http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtml http://www.plob.org/?p=25 bwa的使用需要两中输入文件： Reference genome data（fasta格式 .fa, .fasta, .fna） Short reads data ( 阅读全文

摘要： 转载：http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/18699154201241014835362/ http://blog.sina.com.cn/s/blog_4476400f0100iq0x.html EST 对EST序列进行冗余查找，利用CD_HIT软件 阅读全文

摘要： 1、java启动参数共分为三类； 其一是标准参数 （-），所有的JVM实现都必须实现这些参数的功能，而且向后兼容；其二是非标准参数 （-X），默认jvm实现这些参数的功能，但是并不保证所有jvm实现都满足，且不保证向后兼容；其三是非Stable参数 （-XX），此类参数各个jvm实现会有所不同，将来 阅读全文

摘要： 转载：http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/1869915420124131096557/ MISA工具提供批量识别和定位简单重复序列(SSR)，EST序列或是基因组序列都可以。另外，还提供一个与批量设计引物Primer3的接口工具，通过这个工具，可以把 阅读全文

摘要： 转载：http://boyun.sh.cn/bio/?p=1711 这里对多重序列比对格式(Multiple sequence alignment – MSA)进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等，都需要涉及到多重序列比对。特别是当需要用不同软件对多重比对序列进行批量操作时，会遇到各 阅读全文