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九叶草
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2022年5月28日
可视化U-Net编码器每层的输出(在已经训练好的模型下展示,并不是初始训练阶段展示)
摘要: 想看一下对于一个训练好的模型,其每一层编码阶段的可视化输出是什么样子的。我以3Dircabd肝脏血管分割为例,训练好了一个U-Net模型。然后使用该模型在推理阶段使用,并可视化了每一层编码器。 分割结果: 可视化分为两个展示,分别是有原图和没有原图作为背景的。 无背景 encoder第一层 enco
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posted @ 2022-05-28 16:36 九叶草
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2022年5月24日
对抗生成网络(GAN)简单介绍
摘要: 对抗生成网络主要由生成网络和判别网络构成,GAN在图像领域使用较多。利用生成网络生成假的图像,然后利用判别器是否能判断该图像是假的。 1、用于医学图像分割,一般我们可以利用一个U-Net网络生成分割结果,但是结果或许分割的不是很好。我们这时候就可以利用GAN的优势。通过将分割的结果放入GAN网络中进
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posted @ 2022-05-24 10:09 九叶草
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2022年5月22日
图像形态学操作(cv2库实现)
摘要: #coding:utf-8 import SimpleITK as sitk import numpy as np import cv2 # 膨胀 def dilateion(image): kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (5,
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posted @ 2022-05-22 20:31 九叶草
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过拟合一些解决方案
摘要: 过拟合原因: 1. 训练集的数量级和模型的复杂度不匹配。训练集的数量级要小于模型的复杂度;(模型太复杂,参数就会太大,然而你的数据量又很小) 2. 训练集和测试集特征分布不一致;(用分类猫的训练集,去拟合分类狗的) 3. 样本里的噪音数据干扰过大,大到模型过分记住了噪音特征,反而忽略了真实的输入输出
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posted @ 2022-05-22 16:41 九叶草
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2022年5月21日
利用cv2.morphologyEx提取图像边界
摘要: cv2.morphologyEx(image, cv2.MORPH_GRADIENT, SE)可以参考这篇博客cv2.MORPH_GRADIENT:形态学梯度(morph-grad),可以突出团块(blob)的边缘, 保留物体的边缘轮廓。 #coding:utf-8 import SimpleITK
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posted @ 2022-05-21 16:37 九叶草
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利用cv2.dilate对图像进行膨胀
摘要: cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (7,7))介绍,请看这个博客。我简要说一下cv2.getStructuringElement,可用于构造一个特定大小和形状的结构元素,用于图像形态学处理。其中 MORPH_RECT 就是构造一个全1方形矩阵。代码如
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posted @ 2022-05-21 16:14 九叶草
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2022年5月19日
关于BarchNorm的一些学习
摘要: 《Batch Normalization: Accelerating Deep Network Training by Reducing Internal Covariate Shift》 1、Batch Normalization 并不能缓解深度网络梯度爆炸问题,反而是梯度爆炸的原因。一般通多跳跃
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posted @ 2022-05-19 22:29 九叶草
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2022年5月16日
CNN每层卷积结果视觉展示(3Dircadb肝脏数据为例)
摘要: 试着展示了肝脏每层卷积之后的结果。代码如下: import torch import torch.nn as nn import SimpleITK as sitk import numpy as np def change_indenty(ct): ct[ct < 40] = 40 ct[ct >
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posted @ 2022-05-16 17:13 九叶草
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2022年5月7日
利用csv文件信息,将图片名信息保存到csv文件当中
摘要: 我们可以利用train.csv文件信息, 再结合给定的文件路径(path)信息,可以将给定字目录下的图片名信息整合到scv文件当中。 train.csv文件格式: 图片名信息: 代码如下: from glob import glob import pandas as pd import os def
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posted @ 2022-05-07 20:21 九叶草
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2022年5月6日
利用3D标签,生成RLE标签编码,并保存到csv文件
摘要: # coding:utf-8from glob import globimport osimport SimpleITK as sitkfrom pathlib import Pathimport numpy as npimport imageioimport pandas as pd def rl
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posted @ 2022-05-06 20:16 九叶草
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